RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRT-210ENST00000617474 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRT-210ENST00000617474 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRT-210ENST00000617474 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRT-210ENST00000617474 ANK2Q01484 3957 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRT-210ENST00000617474 FAT1Q14517 4588 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRT-210ENST00000617474 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRT-210ENST00000617474 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-210ENST00000617474 KMT2AQ03164 3969 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRT-210ENST00000617474 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRT-210ENST00000617474 LYSTQ99698 3801 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRT-210ENST00000617474 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH2Q9P225 4427 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRT-210ENST00000617474 MYCBP2O75592 4640 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRT-210ENST00000617474 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRT-210ENST00000617474 RYR1P21817 5038 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRT-210ENST00000617474 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRT-210ENST00000617474 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-12P60413 245 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRT-210ENST00000617474 LCE3AQ5TA76 89 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRT-210ENST00000617474 RYR3Q15413 4870 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-210ENST00000617474 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-210ENST00000617474 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP12-3P60328 96 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-210ENST00000617474 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRT-210ENST00000617474 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PTPRT-210ENST00000617474 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.5□□□□□ -1.37
PTPRT-210ENST00000617474 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-210ENST00000617474 INE1O15225 51 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRT-210ENST00000617474 PKHD1P08F94 4074 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.4□□□□□ -1.39
PTPRT-210ENST00000617474 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-210ENST00000617474 RYR2Q92736 4967 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-210ENST00000617474 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-210ENST00000617474 LRP2P98164 4655 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-210ENST00000617474 HERC2O95714 4834 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRT-210ENST00000617474 MT2AP02795 61 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRT-210ENST00000617474 MT1HP80294 61 aa6.12□□□□□ -1.43
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRT-210ENST00000617474 MT1FP04733 61 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRT-210ENST00000617474 HSPG2P98160 4391 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRT-210ENST00000617474 PKD1P98161 4303 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRT-210ENST00000617474 LPAP08519 4548 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-5P60370 271 aa5.97□□□□□ -1.45
PTPRT-210ENST00000617474 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRT-210ENST00000617474 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRT-210ENST00000617474 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRT-210ENST00000617474 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.79□□□□□ -1.48
PTPRT-210ENST00000617474 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRT-210ENST00000617474 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRT-210ENST00000617474 TNXBP22105 4242 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRT-210ENST00000617474 HERC1Q15751 4861 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRT-210ENST00000617474 MT1XP80297 61 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRT-210ENST00000617474 MT1BP07438 61 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRT-210ENST00000617474 LCE2CQ5TA81 110 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRT-210ENST00000617474 MUC2Q02817 5179 aa5.58□□□□□ -1.52
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRT-210ENST00000617474 RNF213Q63HN8 5207 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-210ENST00000617474 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRT-210ENST00000617474 MUC17Q685J3 4493 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRT-210ENST00000617474 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRT-210ENST00000617474 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.47□□□□□ -1.53
PTPRT-210ENST00000617474 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.39□□□□□ -1.55
PTPRT-210ENST00000617474 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.37□□□□□ -1.55
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.35□□□□□ -1.55
PTPRT-210ENST00000617474 MT1GP13640 62 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRT-210ENST00000617474 LCE3BQ5TA77 95 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP12-4P60329 112 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRT-210ENST00000617474 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.27□□□□□ -1.57
PTPRT-210ENST00000617474 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.24□□□□□ -1.57
PTPRT-210ENST00000617474 LCE2BO14633 110 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.22□□□□□ -1.57
PTPRT-210ENST00000617474 MT1LQ93083 61 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRT-210ENST00000617474 MT1EP04732 61 aa5.03□□□□□ -1.6
PTPRT-210ENST00000617474 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR2EP22531 72 aa4.97□□□□□ -1.61
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