RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.79□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 A0A1B0GU33 70 aa5.78□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 NDUFAF8A1L188 74 aa5.78□□□□□ -1.48
FCHO1-216ENST00000596536 Q5VSD8 79 aa5.75□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.75□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.74□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.73□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 K7ERS5 55 aa5.72□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.72□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.49
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.7□□□□□ -1.5
FCHO1-216ENST00000596536 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.67□□□□□ -1.5
FCHO1-216ENST00000596536 TPRXLQ17RH7 258 aa5.67□□□□□ -1.5
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FCHO1-216ENST00000596536 HSPG2P98160 4391 aa5.63□□□□□ -1.51
FCHO1-216ENST00000596536 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.61□□□□□ -1.51
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FCHO1-216ENST00000596536 A0A0D9SG42 100 aa5.59□□□□□ -1.52
FCHO1-216ENST00000596536 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.56□□□□□ -1.52
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FCHO1-216ENST00000596536 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
FCHO1-216ENST00000596536 J3QL48 77 aa5.52□□□□□ -1.53
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FCHO1-216ENST00000596536 LRP2P98164 4655 aa5.49□□□□□ -1.53
FCHO1-216ENST00000596536 HERC1Q15751 4861 aa5.48□□□□□ -1.53
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FCHO1-216ENST00000596536 XP32Q5T750 250 aa5.45□□□□□ -1.54
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.45□□□□□ -1.54
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.44□□□□□ -1.54
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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FCHO1-216ENST00000596536 S4R3F8 94 aa5.4□□□□□ -1.54
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.37□□□□□ -1.55
FCHO1-216ENST00000596536 MT1HL1P0DM35 61 aa5.35□□□□□ -1.55
FCHO1-216ENST00000596536 RNF213Q63HN8 5207 aa5.35□□□□□ -1.55
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FCHO1-216ENST00000596536 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.26□□□□□ -1.57
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP12-1P59990 96 aa5.21□□□□□ -1.57
FCHO1-216ENST00000596536 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.19□□□□□ -1.58
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FCHO1-216ENST00000596536 M0QZ58 72 aa5.11□□□□□ -1.59
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FCHO1-216ENST00000596536 R4GN34 69 aa5.07□□□□□ -1.6
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.03□□□□□ -1.6
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FCHO1-216ENST00000596536 M0R2T5 61 aa4.93□□□□□ -1.62
FCHO1-216ENST00000596536 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.92□□□□□ -1.62
FCHO1-216ENST00000596536 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.85□□□□□ -1.63
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FCHO1-216ENST00000596536 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.72□□□□□ -1.65
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-10P60014 251 aa4.58□□□□□ -1.68
FCHO1-216ENST00000596536 MT1HP80294 61 aa4.53□□□□□ -1.68
FCHO1-216ENST00000596536 INE1O15225 51 aa4.53□□□□□ -1.68
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.49□□□□□ -1.69
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.46□□□□□ -1.69
FCHO1-216ENST00000596536 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.44□□□□□ -1.7
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FCHO1-216ENST00000596536 LCE3AQ5TA76 89 aa4.4□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 MT2AP02795 61 aa4.39□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 KMT2DO14686 5537 aa4.36□□□□□ -1.71
FCHO1-216ENST00000596536 MT1BP07438 61 aa4.24□□□□□ -1.73
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-5P60370 271 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.23□□□□□ -1.73
FCHO1-216ENST00000596536 MT1XP80297 61 aa4.23□□□□□ -1.73
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FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.19□□□□□ -1.74
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.18□□□□□ -1.74
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP10-12P60413 245 aa4.17□□□□□ -1.74
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.16□□□□□ -1.74
FCHO1-216ENST00000596536 LCE2BO14633 110 aa4.16□□□□□ -1.74
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP12-3P60328 96 aa4.15□□□□□ -1.75
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FCHO1-216ENST00000596536 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.02□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.97□□□□□ -1.77
FCHO1-216ENST00000596536 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-216ENST00000596536 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.88□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.87□□□□□ -1.79
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.82□□□□□ -1.8
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.82□□□□□ -1.8
FCHO1-216ENST00000596536 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.76□□□□□ -1.81
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