RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 PKHD1P08F94 4074 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH2Q9P225 4427 aa4.28□□□□□ -1.72
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.26□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.25□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.24□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.23□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.22□□□□□ -1.73
EFTUD2-218ENST00000590367 FAT1Q14517 4588 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.2□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 PKD1P98161 4303 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 APOBP04114 4563 aaKnown RBP4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 HSPG2P98160 4391 aa4.19□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 A0A0D9SG42 100 aa4.16□□□□□ -1.74
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.15□□□□□ -1.75
EFTUD2-218ENST00000590367 HERC1Q15751 4861 aa4.1□□□□□ -1.75
EFTUD2-218ENST00000590367 MYCBP2O75592 4640 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-218ENST00000590367 C9orf92A6NGG3 77 aa4.09□□□□□ -1.75
EFTUD2-218ENST00000590367 S4R3F8 94 aa4.09□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 PLAC4Q8WY50 150 aa4.08□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.07□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.05□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 XP32Q5T750 250 aa4.03□□□□□ -1.76
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.01□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1HL1P0DM35 61 aa4□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.98□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP12-2P59991 146 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.95□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-8P60410 259 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.93□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP12-1P59990 96 aa3.91□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.9□□□□□ -1.78
EFTUD2-218ENST00000590367 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-218ENST00000590367 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.88□□□□□ -1.79
EFTUD2-218ENST00000590367 M0QZ58 72 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-218ENST00000590367 LRP2P98164 4655 aa3.87□□□□□ -1.79
EFTUD2-218ENST00000590367 PP632Q6XCG6 107 aa3.85□□□□□ -1.79
EFTUD2-218ENST00000590367 RNF213Q63HN8 5207 aa3.82□□□□□ -1.8
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.8□□□□□ -1.8
EFTUD2-218ENST00000590367 INE1O15225 51 aa3.78□□□□□ -1.8
EFTUD2-218ENST00000590367 R4GN34 69 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-218ENST00000590367 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.77□□□□□ -1.81
EFTUD2-218ENST00000590367 TNXBP22105 4242 aa3.73□□□□□ -1.81
EFTUD2-218ENST00000590367 LPAP08519 4548 aa3.71□□□□□ -1.82
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC2Q02817 5179 aa3.63□□□□□ -1.83
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.61□□□□□ -1.83
EFTUD2-218ENST00000590367 M0R2T5 61 aa3.57□□□□□ -1.84
EFTUD2-218ENST00000590367 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.55□□□□□ -1.84
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.54□□□□□ -1.84
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.53□□□□□ -1.84
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.52□□□□□ -1.85
EFTUD2-218ENST00000590367 TNP1P09430 55 aa3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
EFTUD2-218ENST00000590367 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.46□□□□□ -1.86
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.41□□□□□ -1.86
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1HP80294 61 aa3.4□□□□□ -1.86
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE2CQ5TA81 110 aa3.39□□□□□ -1.87
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC17Q685J3 4493 aa3.37□□□□□ -1.87
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.35□□□□□ -1.87
EFTUD2-218ENST00000590367 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.34□□□□□ -1.88
EFTUD2-218ENST00000590367 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-10P60014 251 aa3.27□□□□□ -1.89
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE2BO14633 110 aa3.21□□□□□ -1.9
EFTUD2-218ENST00000590367 MT2AP02795 61 aa3.19□□□□□ -1.9
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.19□□□□□ -1.9
EFTUD2-218ENST00000590367 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1FP04733 61 aa3.16□□□□□ -1.9
EFTUD2-218ENST00000590367 USH2AO75445 5202 aa3.12□□□□□ -1.91
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE3AQ5TA76 89 aa3.11□□□□□ -1.91
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.09□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.09□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SSPOA2VEC9 5147 aa3.09□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.08□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.05□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.01□□□□□ -1.93
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP12-3P60328 96 aa2.98□□□□□ -1.93
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-12P60413 245 aa2.96□□□□□ -1.94
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.96□□□□□ -1.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1BP07438 61 aa2.87□□□□□ -1.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.86□□□□□ -1.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-5P60370 271 aa2.85□□□□□ -1.95
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.84□□□□□ -1.95
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1XP80297 61 aa2.83□□□□□ -1.96
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa2.81□□□□□ -1.96
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.81□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 96.1 ms