RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551155.1

CS-224, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-224ENST00000551155 IMUPQ9GZP8 106 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 H0Y9P7 68 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 SCGB1A1P11684 91 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 OCR1Q9BZK8 76 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 MP68P56378 58 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 C5orf47Q569G3 176 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-224ENST00000551155 LINC00208Q96KT6 92 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 H3BPC8 53 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 MT-ATP8P03928 68 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 MT2AP02795 61 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 S4R3F8 94 aa4.48□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-10P60014 251 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-224ENST00000551155 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 A8MUN3 132 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 MT1FP04733 61 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 CSAG1Q6PB30 78 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 LCA10Q71F78 164 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 KLKP1Q107X0 134 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-224ENST00000551155 NDUFC1O43677 76 aa4.38□□□□□ -1.71
CS-224ENST00000551155 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.38□□□□□ -1.71
CS-224ENST00000551155 SERP2Q8N6R1 65 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-224ENST00000551155 DMAC1Q96GE9 116 aa4.34□□□□□ -1.71
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 ACYP2P14621 99 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 SNURFQ9Y675 71 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 H0YAA0 97 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 C20orf197Q8N268 126 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-224ENST00000551155 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 CRIPTQ9P021 101 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 COX7CP15954 63 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-224ENST00000551155 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 USH2AO75445 5202 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 Q5VV11 94 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-224ENST00000551155 R4GN34 69 aa4.14□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 H7BZZ5 65 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 P0C880 135 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 MT1BP07438 61 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 SSPOA2VEC9 5147 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 COA5Q86WW8 74 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-224ENST00000551155 M0QZ58 72 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 A6NN06 94 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 CCDC179H3BU77 68 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 SEC61GP60059 68 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 PLAC4Q8WY50 150 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
CS-224ENST00000551155 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.02□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-5P60370 271 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 LINC01554Q52M75 96 aa4.01□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-224ENST00000551155 TMEM258P61165 79 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-224ENST00000551155 A0A1B0GU33 70 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-224ENST00000551155 A0A1B0GU69 56 aa3.92□□□□□ -1.78
CS-224ENST00000551155 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
CS-224ENST00000551155 MT1XP80297 61 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 PRR15LQ9BU68 103 aa3.88□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-224ENST00000551155 A0A0D9SG42 100 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 KRTAP12-2P59991 146 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.78□□□□□ -1.8
CS-224ENST00000551155 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.77□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-9P26371 169 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 KRTAP12-1P59990 96 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 V9GYY9 64 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 UQCR11O14957 56 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 PCP4P48539 62 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 KRTAP10-12P60413 245 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 A8MU10 97 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-224ENST00000551155 Q1T7F1 81 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-224ENST00000551155 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-224ENST00000551155 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.66□□□□□ -1.82
CS-224ENST00000551155 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 PSPHP1O15172 72 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-224ENST00000551155 KMT2DO14686 5537 aa3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102 ms