RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549143.5

CS-215, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 2,811 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-215ENST00000549143 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
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CS-215ENST00000549143 Q5VV11 94 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 BRK1Q8WUW1 75 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GU69 56 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 LCA10Q71F78 164 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 A6NED7 52 aa4.23□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 S4R3F8 94 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-215ENST00000549143 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-215ENST00000549143 A8MU10 97 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-215ENST00000549143 SEC61GP60059 68 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-215ENST00000549143 RNF213Q63HN8 5207 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-215ENST00000549143 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-215ENST00000549143 MUC17Q685J3 4493 aa4.14□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 CSAG1Q6PB30 78 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 UQCR11O14957 56 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 PRO0628Q9UI54 55 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 A0A1B0GU33 70 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-215ENST00000549143 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 P0C880 135 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.08□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 LCE2CQ5TA81 110 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 H0YAA0 97 aa4.04□□□□□ -1.76
CS-215ENST00000549143 A0A0D9SG42 100 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-215ENST00000549143 PMAIP1Q13794 54 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-215ENST00000549143 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4□□□□□ -1.77
CS-215ENST00000549143 M0R2T5 61 aa3.99□□□□□ -1.77
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CS-215ENST00000549143 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CS-215ENST00000549143 LINC01554Q52M75 96 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-215ENST00000549143 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
CS-215ENST00000549143 R4GN34 69 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-215ENST00000549143 M0QZ58 72 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-215ENST00000549143 MT1HP80294 61 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-215ENST00000549143 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.9□□□□□ -1.79
CS-215ENST00000549143 A6NN06 94 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-215ENST00000549143 K7ERS5 55 aa3.88□□□□□ -1.79
CS-215ENST00000549143 KRTAP12-2P59991 146 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-215ENST00000549143 KRTAP12-1P59990 96 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-10P60014 251 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-215ENST00000549143 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-215ENST00000549143 PRAC1Q96KF2 57 aa3.79□□□□□ -1.8
CS-215ENST00000549143 MT1FP04733 61 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 MT2AP02795 61 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 CRIPTQ9P021 101 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 ROMO1P60602 79 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-215ENST00000549143 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-215ENST00000549143 PLAC4Q8WY50 150 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 USH2AO75445 5202 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.6□□□□□ -1.83
CS-215ENST00000549143 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-215ENST00000549143 MT1BP07438 61 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-215ENST00000549143 H3BS24 57 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-215ENST00000549143 TNP1P09430 55 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-215ENST00000549143 MT1XP80297 61 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-5P60370 271 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-215ENST00000549143 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CS-215ENST00000549143 KMT2DO14686 5537 aa3.36□□□□□ -1.87
CS-215ENST00000549143 LCE3AQ5TA76 89 aa3.36□□□□□ -1.87
CS-215ENST00000549143 PP632Q6XCG6 107 aa3.36□□□□□ -1.87
CS-215ENST00000549143 SSPOA2VEC9 5147 aa3.35□□□□□ -1.87
CS-215ENST00000549143 KRTAP10-12P60413 245 aa3.33□□□□□ -1.88
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-215ENST00000549143 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.28□□□□□ -1.88
CS-215ENST00000549143 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.27□□□□□ -1.89
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.23□□□□□ -1.89
CS-215ENST00000549143 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 KRTAP12-3P60328 96 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.2□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.17□□□□□ -1.9
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.12□□□□□ -1.91
CS-215ENST00000549143 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
CS-215ENST00000549143 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
CS-215ENST00000549143 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.09□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 NDUFAF8A1L188 74 aa3.06□□□□□ -1.92
CS-215ENST00000549143 LUZP6Q538Z0 58 aa3.04□□□□□ -1.92
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