RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 COX7CP15954 63 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.36□□□□□ -1.07
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.33□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 C20orf197Q8N268 126 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.32□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.3□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 LCE2BO14633 110 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 SNURFQ9Y675 71 aa8.29□□□□□ -1.08
PACS1-208ENST00000529677 A8MUN3 132 aa8.23□□□□□ -1.09
PACS1-208ENST00000529677 DMAC1Q96GE9 116 aa8.19□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 NEBP20929 6669 aa8.18□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.18□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 NDUFC1O43677 76 aa8.17□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.17□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 CCDC179H3BU77 68 aa8.15□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.15□□□□□ -1.1
PACS1-208ENST00000529677 MT2AP02795 61 aa8.14□□□□□ -1.11
PACS1-208ENST00000529677 H7BZZ5 65 aa8.12□□□□□ -1.11
PACS1-208ENST00000529677 S4R3F8 94 aa8.12□□□□□ -1.11
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.11□□□□□ -1.11
PACS1-208ENST00000529677 MT1FP04733 61 aa8.09□□□□□ -1.11
PACS1-208ENST00000529677 LCA10Q71F78 164 aa8.08□□□□□ -1.12
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.06□□□□□ -1.12
PACS1-208ENST00000529677 ACYP2P14621 99 aa8.04□□□□□ -1.12
PACS1-208ENST00000529677 CSAG1Q6PB30 78 aa8□□□□□ -1.13
PACS1-208ENST00000529677 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.99□□□□□ -1.13
PACS1-208ENST00000529677 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.92□□□□□ -1.14
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.91□□□□□ -1.14
PACS1-208ENST00000529677 TMEM258P61165 79 aa7.9□□□□□ -1.14
PACS1-208ENST00000529677 PCP4P48539 62 aa7.88□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP10-10P60014 251 aa7.87□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 COA5Q86WW8 74 aa7.87□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.86□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 H0YAA0 97 aa7.85□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.84□□□□□ -1.15
PACS1-208ENST00000529677 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.69□□□□□ -1.18
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.68□□□□□ -1.18
PACS1-208ENST00000529677 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.65□□□□□ -1.18
PACS1-208ENST00000529677 CRIPTQ9P021 101 aa7.64□□□□□ -1.19
PACS1-208ENST00000529677 MDN1Q9NU22 5596 aa7.64□□□□□ -1.19
PACS1-208ENST00000529677 P0C880 135 aa7.62□□□□□ -1.19
PACS1-208ENST00000529677 KMT2DO14686 5537 aa7.59□□□□□ -1.2
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.58□□□□□ -1.2
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP5-9P26371 169 aa7.51□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 SEC61GP60059 68 aa7.49□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.48□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.48□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.47□□□□□ -1.21
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.46□□□□□ -1.22
PACS1-208ENST00000529677 R4GN34 69 aa7.45□□□□□ -1.22
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GU69 56 aa7.43□□□□□ -1.22
PACS1-208ENST00000529677 M0QZ58 72 aa7.42□□□□□ -1.22
PACS1-208ENST00000529677 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.38□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 PRR15LQ9BU68 103 aa7.37□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 MT1BP07438 61 aa7.36□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 Q1T7F1 81 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 Q5VV11 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 V9GYY9 64 aa7.35□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 A0A1B0GU33 70 aa7.34□□□□□ -1.23
PACS1-208ENST00000529677 A6NN06 94 aa7.29□□□□□ -1.24
PACS1-208ENST00000529677 LINC01554Q52M75 96 aa7.24□□□□□ -1.25
PACS1-208ENST00000529677 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.22□□□□□ -1.25
PACS1-208ENST00000529677 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.22□□□□□ -1.25
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.19□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.19□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 PSPHP1O15172 72 aa7.17□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP10-5P60370 271 aa7.16□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 PLAC4Q8WY50 150 aa7.16□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 UQCR11O14957 56 aa7.15□□□□□ -1.26
PACS1-208ENST00000529677 A0A0D9SG42 100 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2EP22531 72 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2BP35325 72 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2AP35326 72 aa7.1□□□□□ -1.27
PACS1-208ENST00000529677 A8MU10 97 aa7.07□□□□□ -1.28
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP12-1P59990 96 aa7.05□□□□□ -1.28
PACS1-208ENST00000529677 MT1XP80297 61 aa7.03□□□□□ -1.28
PACS1-208ENST00000529677 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.03□□□□□ -1.28
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.02□□□□□ -1.29
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP12-2P59991 146 aa6.99□□□□□ -1.29
PACS1-208ENST00000529677 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.99□□□□□ -1.29
PACS1-208ENST00000529677 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.98□□□□□ -1.29
PACS1-208ENST00000529677 A6NED7 52 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-208ENST00000529677 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.96□□□□□ -1.3
PACS1-208ENST00000529677 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.91□□□□□ -1.3
PACS1-208ENST00000529677 SPRR2DP22532 72 aa6.87□□□□□ -1.31
PACS1-208ENST00000529677 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.84□□□□□ -1.31
PACS1-208ENST00000529677 LCE3BQ5TA77 95 aa6.77□□□□□ -1.33
PACS1-208ENST00000529677 K7ERS5 55 aa6.76□□□□□ -1.33
PACS1-208ENST00000529677 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.7□□□□□ -1.34
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP10-12P60413 245 aa6.69□□□□□ -1.34
PACS1-208ENST00000529677 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.69□□□□□ -1.34
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.58□□□□□ -1.36
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.57□□□□□ -1.36
PACS1-208ENST00000529677 BRK1Q8WUW1 75 aa6.57□□□□□ -1.36
PACS1-208ENST00000529677 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.57□□□□□ -1.36
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