RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 ABRACLQ9P1F3 81 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 ATMQ13315 3056 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 NRAPQ86VF7 1730 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 ITPR1Q14643 2758 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.19□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 M0R1W7 72 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MT1EP04732 61 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MT1MQ8N339 61 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 S100ZQ8WXG8 99 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MT1LQ93083 61 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 FREM2Q5SZK8 3169 aa-0.2□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 DEFB1P60022 68 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 SMIM5Q71RC9 77 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 RELNP78509 3460 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 KIF1AQ12756 1690 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 NHSQ6T4R5 1651 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 PCNTO95613 3336 aa-0.21□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 EFCAB5A4FU69 1503 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CLASP1Q7Z460 1538 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 GLI2P10070 1586 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MT2AP02795 61 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CEP350Q5VT06 3117 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 LY75O60449 1722 aa-0.22□□□□□ -2.44
SSB-211ENST00000490914 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-0.22□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 ITPR2Q14571 2701 aa-0.22□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 C3P01024 1663 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 MT1BP07438 61 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 TNP1P09430 55 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 EP400Q96L91 3159 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 TIAM1Q13009 1591 aa-0.23□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 KIF21BO75037 1637 aa-0.24□□□□□ -2.45
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SSB-211ENST00000490914 MADDQ8WXG6 1647 aa-0.24□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 SZT2Q5T011 3432 aa-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 MUC3AQ02505 3323 aa-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 A0A1B0GUL6 1792 aa-0.25□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 VPS13CQ709C8 3753 aa-0.26□□□□□ -2.45
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SSB-211ENST00000490914 LINC01546A6NGU7 62 aa-0.26□□□□□ -2.45
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SSB-211ENST00000490914 CEP250Q9BV73 2442 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 UNC80Q8N2C7 3258 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 A8MTW9 85 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 KAAG1Q9UBP8 84 aa-0.27□□□□□ -2.45
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