RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488338.2

LAMTOR4-210, Transcript of late endosomal/lysosomal adaptor, MAPK and MTOR activator 4, humanhuman

TSL 3

Gene LAMTOR4, Length 533 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMTOR4-210ENST00000488338 NDUFC1O43677 76 aa7□□□□□ -1.29
LAMTOR4-210ENST00000488338 DMAC1Q96GE9 116 aa7□□□□□ -1.29
LAMTOR4-210ENST00000488338 MT1FP04733 61 aa6.98□□□□□ -1.29
LAMTOR4-210ENST00000488338 COX7CP15954 63 aa6.98□□□□□ -1.29
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.96□□□□□ -1.3
LAMTOR4-210ENST00000488338 ACYP2P14621 99 aa6.94□□□□□ -1.3
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.92□□□□□ -1.3
LAMTOR4-210ENST00000488338 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.92□□□□□ -1.3
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.87□□□□□ -1.31
LAMTOR4-210ENST00000488338 H0YAA0 97 aa6.84□□□□□ -1.31
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.84□□□□□ -1.31
LAMTOR4-210ENST00000488338 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.82□□□□□ -1.32
LAMTOR4-210ENST00000488338 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.79□□□□□ -1.32
LAMTOR4-210ENST00000488338 H7BZZ5 65 aa6.77□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 CRIPTQ9P021 101 aa6.76□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 USH2AO75445 5202 aa6.76□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 LCE2BO14633 110 aa6.75□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.74□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.74□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.72□□□□□ -1.33
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.71□□□□□ -1.34
LAMTOR4-210ENST00000488338 CCDC179H3BU77 68 aa6.71□□□□□ -1.34
LAMTOR4-210ENST00000488338 COA5Q86WW8 74 aa6.68□□□□□ -1.34
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.67□□□□□ -1.34
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.67□□□□□ -1.34
LAMTOR4-210ENST00000488338 SSPOA2VEC9 5147 aa6.63□□□□□ -1.35
LAMTOR4-210ENST00000488338 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
LAMTOR4-210ENST00000488338 P0C880 135 aa6.6□□□□□ -1.35
LAMTOR4-210ENST00000488338 Q5VV11 94 aa6.59□□□□□ -1.35
LAMTOR4-210ENST00000488338 R4GN34 69 aa6.59□□□□□ -1.35
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.58□□□□□ -1.36
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.56□□□□□ -1.36
LAMTOR4-210ENST00000488338 TMEM258P61165 79 aa6.54□□□□□ -1.36
LAMTOR4-210ENST00000488338 SEC61GP60059 68 aa6.53□□□□□ -1.36
LAMTOR4-210ENST00000488338 M0QZ58 72 aa6.52□□□□□ -1.37
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.5□□□□□ -1.37
LAMTOR4-210ENST00000488338 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.49□□□□□ -1.37
LAMTOR4-210ENST00000488338 MT1BP07438 61 aa6.48□□□□□ -1.37
LAMTOR4-210ENST00000488338 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
LAMTOR4-210ENST00000488338 LINC01554Q52M75 96 aa6.41□□□□□ -1.38
LAMTOR4-210ENST00000488338 PLAC4Q8WY50 150 aa6.41□□□□□ -1.38
LAMTOR4-210ENST00000488338 A0A1B0GU69 56 aa6.37□□□□□ -1.39
LAMTOR4-210ENST00000488338 A6NN06 94 aa6.36□□□□□ -1.39
LAMTOR4-210ENST00000488338 A0A1B0GU33 70 aa6.33□□□□□ -1.4
LAMTOR4-210ENST00000488338 PCP4P48539 62 aa6.32□□□□□ -1.4
LAMTOR4-210ENST00000488338 PRR15LQ9BU68 103 aa6.32□□□□□ -1.4
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP10-5P60370 271 aa6.3□□□□□ -1.4
LAMTOR4-210ENST00000488338 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.28□□□□□ -1.4
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.27□□□□□ -1.41
LAMTOR4-210ENST00000488338 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.27□□□□□ -1.41
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.21□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.18□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 A0A0D9SG42 100 aa6.17□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 MT1XP80297 61 aa6.17□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 V9GYY9 64 aa6.17□□□□□ -1.42
LAMTOR4-210ENST00000488338 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.12□□□□□ -1.43
LAMTOR4-210ENST00000488338 UQCR11O14957 56 aa6.1□□□□□ -1.43
LAMTOR4-210ENST00000488338 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
LAMTOR4-210ENST00000488338 Q1T7F1 81 aa6.09□□□□□ -1.43
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.09□□□□□ -1.43
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.08□□□□□ -1.44
LAMTOR4-210ENST00000488338 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP12-1P59990 96 aa6.04□□□□□ -1.44
LAMTOR4-210ENST00000488338 A8MU10 97 aa6.03□□□□□ -1.44
LAMTOR4-210ENST00000488338 PSPHP1O15172 72 aa6□□□□□ -1.45
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP12-2P59991 146 aa6□□□□□ -1.45
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.97□□□□□ -1.45
LAMTOR4-210ENST00000488338 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.96□□□□□ -1.46
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP10-12P60413 245 aa5.89□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 KMT2DO14686 5537 aa5.88□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 A6NED7 52 aa5.86□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 K7ERS5 55 aa5.86□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.84□□□□□ -1.47
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP5-9P26371 169 aa5.82□□□□□ -1.48
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.78□□□□□ -1.48
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.78□□□□□ -1.48
LAMTOR4-210ENST00000488338 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.76□□□□□ -1.49
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.74□□□□□ -1.49
LAMTOR4-210ENST00000488338 TNP1P09430 55 aa5.73□□□□□ -1.49
LAMTOR4-210ENST00000488338 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.73□□□□□ -1.49
LAMTOR4-210ENST00000488338 MDN1Q9NU22 5596 aa5.68□□□□□ -1.5
LAMTOR4-210ENST00000488338 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.66□□□□□ -1.5
LAMTOR4-210ENST00000488338 NEBP20929 6669 aa5.64□□□□□ -1.51
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2EP22531 72 aa5.58□□□□□ -1.52
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2BP35325 72 aa5.58□□□□□ -1.52
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2AP35326 72 aa5.58□□□□□ -1.52
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.57□□□□□ -1.52
LAMTOR4-210ENST00000488338 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.52□□□□□ -1.53
LAMTOR4-210ENST00000488338 LCE3AQ5TA76 89 aa5.52□□□□□ -1.53
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.5□□□□□ -1.53
LAMTOR4-210ENST00000488338 ROMO1P60602 79 aa5.47□□□□□ -1.53
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.47□□□□□ -1.53
LAMTOR4-210ENST00000488338 MT1EP04732 61 aa5.46□□□□□ -1.54
LAMTOR4-210ENST00000488338 BRK1Q8WUW1 75 aa5.4□□□□□ -1.54
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.39□□□□□ -1.55
LAMTOR4-210ENST00000488338 SPRR2DP22532 72 aa5.39□□□□□ -1.55
LAMTOR4-210ENST00000488338 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.38□□□□□ -1.55
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