RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.85□□□□□ -1.47
NISCH-211ENST00000488243 SSPOA2VEC9 5147 aa5.81□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 DMAC1Q96GE9 116 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.8□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 CCDC179H3BU77 68 aa5.79□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 H7BZZ5 65 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 USH2AO75445 5202 aa5.78□□□□□ -1.48
NISCH-211ENST00000488243 ACYP2P14621 99 aa5.77□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 S4R3F8 94 aa5.74□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
NISCH-211ENST00000488243 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.71□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 PCP4P48539 62 aa5.7□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 TMEM258P61165 79 aa5.69□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 CSAG1Q6PB30 78 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 LCA10Q71F78 164 aa5.67□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.66□□□□□ -1.5
NISCH-211ENST00000488243 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.64□□□□□ -1.51
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.62□□□□□ -1.51
NISCH-211ENST00000488243 COA5Q86WW8 74 aa5.6□□□□□ -1.51
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.58□□□□□ -1.52
NISCH-211ENST00000488243 H0YAA0 97 aa5.56□□□□□ -1.52
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.55□□□□□ -1.52
NISCH-211ENST00000488243 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.51□□□□□ -1.53
NISCH-211ENST00000488243 LCE2BO14633 110 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 MT2AP02795 61 aa5.46□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-10P60014 251 aa5.44□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 CRIPTQ9P021 101 aa5.43□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 NEBP20929 6669 aa5.42□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 SEC61GP60059 68 aa5.42□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.42□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.42□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 MT1FP04733 61 aa5.41□□□□□ -1.54
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.39□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.36□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 V9GYY9 64 aa5.36□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 PRR15LQ9BU68 103 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.34□□□□□ -1.55
NISCH-211ENST00000488243 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GU69 56 aa5.33□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 P0C880 135 aa5.32□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 M0QZ58 72 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 Q1T7F1 81 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 R4GN34 69 aa5.29□□□□□ -1.56
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.26□□□□□ -1.57
NISCH-211ENST00000488243 A0A1B0GU33 70 aa5.24□□□□□ -1.57
NISCH-211ENST00000488243 Q5VV11 94 aa5.23□□□□□ -1.57
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.19□□□□□ -1.58
NISCH-211ENST00000488243 UQCR11O14957 56 aa5.16□□□□□ -1.58
NISCH-211ENST00000488243 A6NN06 94 aa5.15□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 PSPHP1O15172 72 aa5.12□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.11□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 LINC01554Q52M75 96 aa5.1□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.09□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 PLAC4Q8WY50 150 aa5.09□□□□□ -1.59
NISCH-211ENST00000488243 MT1BP07438 61 aa5.08□□□□□ -1.6
NISCH-211ENST00000488243 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.04□□□□□ -1.6
NISCH-211ENST00000488243 MDN1Q9NU22 5596 aa5.04□□□□□ -1.6
NISCH-211ENST00000488243 A6NED7 52 aa5.02□□□□□ -1.61
NISCH-211ENST00000488243 A0A0D9SG42 100 aa5.01□□□□□ -1.61
NISCH-211ENST00000488243 KMT2DO14686 5537 aa5□□□□□ -1.61
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.99□□□□□ -1.61
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.99□□□□□ -1.61
NISCH-211ENST00000488243 A8MU10 97 aa4.96□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP12-1P59990 96 aa4.96□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.96□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-9P26371 169 aa4.95□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.95□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 K7ERS5 55 aa4.94□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-5P60370 271 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.92□□□□□ -1.62
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP12-2P59991 146 aa4.9□□□□□ -1.63
NISCH-211ENST00000488243 MT1XP80297 61 aa4.86□□□□□ -1.63
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.8□□□□□ -1.64
NISCH-211ENST00000488243 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.79□□□□□ -1.64
NISCH-211ENST00000488243 BRK1Q8WUW1 75 aa4.76□□□□□ -1.65
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2EP22531 72 aa4.75□□□□□ -1.65
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2BP35325 72 aa4.75□□□□□ -1.65
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2AP35326 72 aa4.75□□□□□ -1.65
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.71□□□□□ -1.66
NISCH-211ENST00000488243 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.68□□□□□ -1.66
NISCH-211ENST00000488243 TNP1P09430 55 aa4.67□□□□□ -1.66
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-12P60413 245 aa4.66□□□□□ -1.66
NISCH-211ENST00000488243 ROMO1P60602 79 aa4.63□□□□□ -1.67
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.63□□□□□ -1.67
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
NISCH-211ENST00000488243 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.61□□□□□ -1.67
NISCH-211ENST00000488243 SPRR2DP22532 72 aa4.59□□□□□ -1.67
NISCH-211ENST00000488243 PRO0628Q9UI54 55 aa4.58□□□□□ -1.68
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.56□□□□□ -1.68
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.53□□□□□ -1.68
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