RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 PKHD1P08F94 4074 aa3.32□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH2Q9P225 4427 aa3.31□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.3□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 HSPG2P98160 4391 aa3.29□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.28□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.27□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.27□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 XP32Q5T750 250 aa3.26□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.25□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.24□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.23□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 PKD1P98161 4303 aa3.23□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 MYCBP2O75592 4640 aa3.23□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.22□□□□□ -1.89
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.21□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 ROMO1P60602 79 aa3.18□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 HERC1Q15751 4861 aa3.18□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 H0YAA0 97 aa3.17□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.16□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 A8MUU9 505 aa3.16□□□□□ -1.9
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.15□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 S4R3F8 94 aa3.14□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.13□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.12□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.12□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 NDUFAF8A1L188 74 aa3.11□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 LRP2P98164 4655 aa3.1□□□□□ -1.91
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-10P60014 251 aa3.06□□□□□ -1.92
SHQ1-205ENST00000468371 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.05□□□□□ -1.92
SHQ1-205ENST00000468371 R4GN34 69 aa3.04□□□□□ -1.92
SHQ1-205ENST00000468371 M0QZ58 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SHQ1-205ENST00000468371 LUZP6Q538Z0 58 aa3.03□□□□□ -1.92
SHQ1-205ENST00000468371 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.03□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.02□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.02□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.02□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 P0C880 135 aa3.01□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 RNF213Q63HN8 5207 aa3□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.97□□□□□ -1.93
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.95□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP12-2P59991 146 aa2.93□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.93□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 MT1HP80294 61 aa2.93□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0A0MQY5 61 aa2.91□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 LPAP08519 4548 aa2.91□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 TNXBP22105 4242 aa2.9□□□□□ -1.94
SHQ1-205ENST00000468371 PLAC4Q8WY50 150 aa2.88□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP12-1P59990 96 aa2.86□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.86□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.85□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.84□□□□□ -1.95
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa2.84□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa2.84□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.83□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP2.83□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 MUC2Q02817 5179 aa2.8□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.8□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 LCE2CQ5TA81 110 aa2.8□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 LORP23490 312 aaPredicted RBP2.79□□□□□ -1.96
SHQ1-205ENST00000468371 PRO2289Q9P1D8 64 aa2.77□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 MT2AP02795 61 aa2.77□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 TNP1P09430 55 aa2.76□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 PP632Q6XCG6 107 aa2.73□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.72□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 MT1FP04733 61 aa2.72□□□□□ -1.97
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa2.69□□□□□ -1.98
SHQ1-205ENST00000468371 MUC17Q685J3 4493 aa2.67□□□□□ -1.98
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa2.64□□□□□ -1.99
SHQ1-205ENST00000468371 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa2.61□□□□□ -1.99
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.6□□□□□ -1.99
SHQ1-205ENST00000468371 LCE2BO14633 110 aa2.58□□□□□ -2
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.55□□□□□ -2
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.52□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.49□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 USH2AO75445 5202 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-5P60370 271 aa2.47□□□□□ -2.01
SHQ1-205ENST00000468371 MT1BP07438 61 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 LCE3AQ5TA76 89 aa2.45□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.43□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2EP22531 72 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2BP35325 72 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2AP35326 72 aa2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.41□□□□□ -2.02
SHQ1-205ENST00000468371 SSPOA2VEC9 5147 aa2.4□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-12P60413 245 aa2.38□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP12-3P60328 96 aa2.37□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 INE1O15225 51 aa2.36□□□□□ -2.03
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR2DP22532 72 aa2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms