RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GU33 70 aa8.29□□□□□ -1.08
SHQ1-202ENST00000444040 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.28□□□□□ -1.08
SHQ1-202ENST00000444040 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.27□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 PRAC1Q96KF2 57 aa8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 MT1HL1P0DM35 61 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 MYCBP2O75592 4640 aa8.25□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.24□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.22□□□□□ -1.09
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SHQ1-202ENST00000444040 S4R3F8 94 aa8.1□□□□□ -1.11
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.07□□□□□ -1.12
SHQ1-202ENST00000444040 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
SHQ1-202ENST00000444040 TPRXLQ17RH7 258 aa8.04□□□□□ -1.12
SHQ1-202ENST00000444040 CSAG1Q6PB30 78 aa8.04□□□□□ -1.12
SHQ1-202ENST00000444040 LPAP08519 4548 aa8.03□□□□□ -1.12
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.01□□□□□ -1.13
SHQ1-202ENST00000444040 LRP2P98164 4655 aa8□□□□□ -1.13
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01554Q52M75 96 aa7.96□□□□□ -1.14
SHQ1-202ENST00000444040 K7ERS5 55 aa7.95□□□□□ -1.14
SHQ1-202ENST00000444040 P0C880 135 aa7.95□□□□□ -1.14
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.93□□□□□ -1.14
SHQ1-202ENST00000444040 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.92□□□□□ -1.14
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0D9SG42 100 aa7.88□□□□□ -1.15
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.86□□□□□ -1.15
SHQ1-202ENST00000444040 ROMO1P60602 79 aa7.79□□□□□ -1.16
SHQ1-202ENST00000444040 CRIPTQ9P021 101 aa7.74□□□□□ -1.17
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP12-2P59991 146 aa7.73□□□□□ -1.17
SHQ1-202ENST00000444040 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
SHQ1-202ENST00000444040 MUC17Q685J3 4493 aa7.7□□□□□ -1.18
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP12-1P59990 96 aa7.69□□□□□ -1.18
SHQ1-202ENST00000444040 M0QZ58 72 aa7.69□□□□□ -1.18
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.65□□□□□ -1.18
SHQ1-202ENST00000444040 J3QL48 77 aa7.62□□□□□ -1.19
SHQ1-202ENST00000444040 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.62□□□□□ -1.19
SHQ1-202ENST00000444040 HERC2O95714 4834 aa7.61□□□□□ -1.19
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.55□□□□□ -1.2
SHQ1-202ENST00000444040 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.51□□□□□ -1.21
SHQ1-202ENST00000444040 R4GN34 69 aa7.5□□□□□ -1.21
SHQ1-202ENST00000444040 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
SHQ1-202ENST00000444040 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.44□□□□□ -1.22
SHQ1-202ENST00000444040 MUC2Q02817 5179 aa7.36□□□□□ -1.23
SHQ1-202ENST00000444040 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
SHQ1-202ENST00000444040 HMCN2Q8NDA2 5059 aa7.23□□□□□ -1.25
SHQ1-202ENST00000444040 HERC1Q15751 4861 aa7.23□□□□□ -1.25
SHQ1-202ENST00000444040 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.21□□□□□ -1.26
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.15□□□□□ -1.26
SHQ1-202ENST00000444040 LCE2CQ5TA81 110 aa7.11□□□□□ -1.27
SHQ1-202ENST00000444040 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.09□□□□□ -1.27
SHQ1-202ENST00000444040 H3BS24 57 aa7.05□□□□□ -1.28
SHQ1-202ENST00000444040 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.02□□□□□ -1.29
SHQ1-202ENST00000444040 PP632Q6XCG6 107 aa6.95□□□□□ -1.3
SHQ1-202ENST00000444040 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.91□□□□□ -1.3
SHQ1-202ENST00000444040 RNF213Q63HN8 5207 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 MT1HP80294 61 aa6.9□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.89□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFAF8A1L188 74 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 PLAC4Q8WY50 150 aa6.88□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 M0R2T5 61 aa6.85□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 TNP1P09430 55 aa6.84□□□□□ -1.31
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.78□□□□□ -1.32
SHQ1-202ENST00000444040 MT2AP02795 61 aa6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-202ENST00000444040 MT1FP04733 61 aa6.77□□□□□ -1.33
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.75□□□□□ -1.33
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-10P60014 251 aa6.72□□□□□ -1.33
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.63□□□□□ -1.35
SHQ1-202ENST00000444040 MT1BP07438 61 aa6.54□□□□□ -1.36
SHQ1-202ENST00000444040 LCE3AQ5TA76 89 aa6.51□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 LUZP6Q538Z0 58 aa6.49□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-5P60370 271 aa6.48□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 MT1XP80297 61 aa6.47□□□□□ -1.37
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.38□□□□□ -1.39
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-12P60413 245 aa6.28□□□□□ -1.4
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
SHQ1-202ENST00000444040 LCE2BO14633 110 aa6.22□□□□□ -1.41
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP12-3P60328 96 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1-202ENST00000444040 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.2□□□□□ -1.42
SHQ1-202ENST00000444040 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
SHQ1-202ENST00000444040 A0A0A0MQY5 61 aa6.08□□□□□ -1.44
SHQ1-202ENST00000444040 USH2AO75445 5202 aa6.07□□□□□ -1.44
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.98□□□□□ -1.45
SHQ1-202ENST00000444040 KMT2DO14686 5537 aa5.91□□□□□ -1.46
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.9□□□□□ -1.47
SHQ1-202ENST00000444040 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.84□□□□□ -1.47
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.78□□□□□ -1.48
SHQ1-202ENST00000444040 SSPOA2VEC9 5147 aa5.7□□□□□ -1.5
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.65□□□□□ -1.51
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.62□□□□□ -1.51
SHQ1-202ENST00000444040 MT1EP04732 61 aa5.61□□□□□ -1.51
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.6□□□□□ -1.51
SHQ1-202ENST00000444040 MT1LQ93083 61 aa5.59□□□□□ -1.51
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.58□□□□□ -1.52
SHQ1-202ENST00000444040 INE1O15225 51 aa5.56□□□□□ -1.52
SHQ1-202ENST00000444040 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-202ENST00000444040 FSIP2Q5CZC0 6907 aa5.43□□□□□ -1.54
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.42□□□□□ -1.54
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