RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438777.5

CCDC18-AS1-211, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCDC18-AS1, Length 752 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SEC61GP60059 68 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC00208Q96KT6 92 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.03□□□□□ -1.92
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 TMEM258P61165 79 aa3.02□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.02□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.02□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SNURFQ9Y675 71 aa3.02□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RPS28P62857 69 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.99□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.98□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LRP2P98164 4655 aa2.96□□□□□ -1.93
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAM236CP0DP71 79 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPINK7P58062 85 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LPAP08519 4548 aa2.96□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HRES1P13985 223 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 DMAC1Q96GE9 116 aa2.95□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HERC1Q15751 4861 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A8MUN3 132 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PCOTHQ58A44 107 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MUC17Q685J3 4493 aa2.94□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.93□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COX6B2Q6YFQ2 88 aa2.91□□□□□ -1.94
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ACYP2P14621 99 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 C4orf26Q17RF5 130 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa2.89□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.88□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.87□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT3P25713 68 aa2.87□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 COA5Q86WW8 74 aa2.87□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 V9GYY9 64 aa2.87□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa2.85□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.84□□□□□ -1.95
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q1T7F1 81 aa2.81□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.8□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa2.79□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LCA10Q71F78 164 aa2.79□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 S4R3F8 94 aa2.79□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa2.78□□□□□ -1.96
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MUC2Q02817 5179 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 H0YAA0 97 aa2.76□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.75□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CSAG1Q6PB30 78 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 RNF213Q63HN8 5207 aa2.74□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRAC1Q96KF2 57 aa2.73□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT1HP80294 61 aa2.72□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRR15LQ9BU68 103 aa2.72□□□□□ -1.97
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 Q5VV11 94 aa2.71□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A1B0GU69 56 aa2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 NDUFAF8A1L188 74 aa2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PRO0628Q9UI54 55 aa2.7□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PSPHP1O15172 72 aa2.67□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.66□□□□□ -1.98
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 P0C880 135 aa2.65□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ADM2Q7Z4H4 148 aa2.65□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 UQCR11O14957 56 aa2.64□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A1B0GU33 70 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A6NED7 52 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 BRK1Q8WUW1 75 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CRIPTQ9P021 101 aa2.63□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 M0QZ58 72 aa2.62□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPATA8Q6RVD6 105 aa2.62□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.62□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 M0R2T5 61 aa2.6□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT2AP02795 61 aa2.6□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.6□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.59□□□□□ -1.99
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT1FP04733 61 aa2.58□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPRR2GQ9BYE4 73 aa2.58□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A6NN06 94 aa2.57□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PMAIP1Q13794 54 aa2.57□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.57□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 R4GN34 69 aa2.56□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A8MU10 97 aa2.54□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.54□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-10P60014 251 aa2.53□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa2.53□□□□□ -2
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 K7ERS5 55 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP12-1P59990 96 aa2.51□□□□□ -2.01
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP12-2P59991 146 aa2.48□□□□□ -2.01
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 A0A0D9SG42 100 aa2.47□□□□□ -2.01
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT1BP07438 61 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LCE1EQ5T753 118 aa2.46□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LINC01554Q52M75 96 aa2.45□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 LCE1FQ5T754 118 aa2.44□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.44□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-12P60413 245 aa2.43□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.42□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 PLAC4Q8WY50 150 aa2.41□□□□□ -2.02
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 ROMO1P60602 79 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 MT1XP80297 61 aa2.38□□□□□ -2.03
CCDC18-AS1-211ENST00000438777 KRTAP10-5P60370 271 aa2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.6 ms