RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427220.5

TTLL3-210, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTLL3, Length 3,233 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-210ENST00000427220 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
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TTLL3-210ENST00000427220 XP32Q5T750 250 aa10.26□□□□□ -0.77
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0D9SG42 100 aa10.24□□□□□ -0.77
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TTLL3-210ENST00000427220 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.61□□□□□ -0.87
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TTLL3-210ENST00000427220 ROMO1P60602 79 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL3-210ENST00000427220 M0QZ58 72 aa9.55□□□□□ -0.88
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.53□□□□□ -0.88
TTLL3-210ENST00000427220 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.88
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TTLL3-210ENST00000427220 H3BS24 57 aa9.36□□□□□ -0.91
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TTLL3-210ENST00000427220 RNF213Q63HN8 5207 aa9.24□□□□□ -0.93
TTLL3-210ENST00000427220 MUC17Q685J3 4493 aa9.24□□□□□ -0.93
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TTLL3-210ENST00000427220 UBR4Q5T4S7 5183 aa9.01□□□□□ -0.97
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.93□□□□□ -0.98
TTLL3-210ENST00000427220 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
TTLL3-210ENST00000427220 NDUFAF8A1L188 74 aa8.74□□□□□ -1.01
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.57□□□□□ -1.04
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TTLL3-210ENST00000427220 PP632Q6XCG6 107 aa8.24□□□□□ -1.09
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TTLL3-210ENST00000427220 FSIP2Q5CZC0 6907 aa8.04□□□□□ -1.12
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP10-5P60370 271 aa7.88□□□□□ -1.15
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.82□□□□□ -1.16
TTLL3-210ENST00000427220 A0A0A0MQY5 61 aa7.81□□□□□ -1.16
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP10-12P60413 245 aa7.79□□□□□ -1.16
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.67□□□□□ -1.18
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP12-3P60328 96 aa7.67□□□□□ -1.18
TTLL3-210ENST00000427220 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.63□□□□□ -1.19
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TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.57□□□□□ -1.2
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.56□□□□□ -1.2
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.47□□□□□ -1.21
TTLL3-210ENST00000427220 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.46□□□□□ -1.22
TTLL3-210ENST00000427220 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
TTLL3-210ENST00000427220 SSPOA2VEC9 5147 aa7.3□□□□□ -1.24
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.25□□□□□ -1.25
TTLL3-210ENST00000427220 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.11□□□□□ -1.27
TTLL3-210ENST00000427220 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TTLL3-210ENST00000427220 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.09□□□□□ -1.27
TTLL3-210ENST00000427220 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7□□□□□ -1.29
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.95□□□□□ -1.3
TTLL3-210ENST00000427220 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.94□□□□□ -1.3
TTLL3-210ENST00000427220 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.84□□□□□ -1.31
TTLL3-210ENST00000427220 MT1EP04732 61 aa6.8□□□□□ -1.32
TTLL3-210ENST00000427220 MT1LQ93083 61 aa6.79□□□□□ -1.32
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