RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.63□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.62□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 ATOX1O00244 68 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 Q5VV11 94 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 LCA10Q71F78 164 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 S4R3F8 94 aa5.61□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 C5orf47Q569G3 176 aa5.6□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 H0Y9P7 68 aa5.59□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 J3QR89 54 aa5.59□□□□□ -1.51
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.59□□□□□ -1.51
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PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.54□□□□□ -1.52
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PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-5P60370 271 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.52□□□□□ -1.53
PRAME-204ENST00000403441 KLKP1Q107X0 134 aa5.5□□□□□ -1.53
PRAME-204ENST00000403441 LINC00208Q96KT6 92 aa5.5□□□□□ -1.53
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PRAME-204ENST00000403441 KRTAP5-9P26371 169 aa5.49□□□□□ -1.53
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PRAME-204ENST00000403441 H3BPC8 53 aa5.47□□□□□ -1.53
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PRAME-204ENST00000403441 MDN1Q9NU22 5596 aa5.46□□□□□ -1.54
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PRAME-204ENST00000403441 K7ERU9 68 aa5.43□□□□□ -1.54
PRAME-204ENST00000403441 MT-ATP8P03928 68 aa5.41□□□□□ -1.54
PRAME-204ENST00000403441 NDUFC1O43677 76 aa5.4□□□□□ -1.54
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PRAME-204ENST00000403441 LCE3BQ5TA77 95 aa5.39□□□□□ -1.55
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PRAME-204ENST00000403441 DMAC1Q96GE9 116 aa5.37□□□□□ -1.55
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PRAME-204ENST00000403441 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.36□□□□□ -1.55
PRAME-204ENST00000403441 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.34□□□□□ -1.55
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PRAME-204ENST00000403441 SPRR2BP35325 72 aa5.29□□□□□ -1.56
PRAME-204ENST00000403441 SPRR2AP35326 72 aa5.29□□□□□ -1.56
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PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.28□□□□□ -1.56
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PRAME-204ENST00000403441 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.27□□□□□ -1.57
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PRAME-204ENST00000403441 P0C880 135 aa5.21□□□□□ -1.58
PRAME-204ENST00000403441 ACYP2P14621 99 aa5.2□□□□□ -1.58
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.2□□□□□ -1.58
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PRAME-204ENST00000403441 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.17□□□□□ -1.58
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.17□□□□□ -1.58
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PRAME-204ENST00000403441 R4GN34 69 aa5.13□□□□□ -1.59
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PRAME-204ENST00000403441 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.1□□□□□ -1.59
PRAME-204ENST00000403441 M0QZ58 72 aa5.09□□□□□ -1.59
PRAME-204ENST00000403441 COX7CP15954 63 aa5.06□□□□□ -1.6
PRAME-204ENST00000403441 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-204ENST00000403441 LCE1DQ5T752 114 aa5.05□□□□□ -1.6
PRAME-204ENST00000403441 PCP4P48539 62 aa5.03□□□□□ -1.6
PRAME-204ENST00000403441 H7BZZ5 65 aa4.98□□□□□ -1.61
PRAME-204ENST00000403441 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.98□□□□□ -1.61
PRAME-204ENST00000403441 LINC01554Q52M75 96 aa4.97□□□□□ -1.61
PRAME-204ENST00000403441 COA5Q86WW8 74 aa4.97□□□□□ -1.61
PRAME-204ENST00000403441 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.96□□□□□ -1.62
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.93□□□□□ -1.62
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.93□□□□□ -1.62
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.92□□□□□ -1.62
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-12P60413 245 aa4.91□□□□□ -1.62
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.9□□□□□ -1.63
PRAME-204ENST00000403441 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.87□□□□□ -1.63
PRAME-204ENST00000403441 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.86□□□□□ -1.63
PRAME-204ENST00000403441 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
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PRAME-204ENST00000403441 SEC61GP60059 68 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-204ENST00000403441 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.79□□□□□ -1.64
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GU33 70 aa4.75□□□□□ -1.65
PRAME-204ENST00000403441 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.74□□□□□ -1.65
PRAME-204ENST00000403441 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.73□□□□□ -1.65
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.72□□□□□ -1.65
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP12-1P59990 96 aa4.69□□□□□ -1.66
PRAME-204ENST00000403441 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.69□□□□□ -1.66
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PRAME-204ENST00000403441 A0A0D9SG42 100 aa4.67□□□□□ -1.66
PRAME-204ENST00000403441 TMEM258P61165 79 aa4.64□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.62□□□□□ -1.67
PRAME-204ENST00000403441 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.61□□□□□ -1.67
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