RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP12-3P60328 96 aa4.22□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 MT1HL1P0DM35 61 aa4.21□□□□□ -1.74
HERC3-202ENST00000402738 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.21□□□□□ -1.74
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.16□□□□□ -1.74
HERC3-202ENST00000402738 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.14□□□□□ -1.75
HERC3-202ENST00000402738 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.09□□□□□ -1.75
HERC3-202ENST00000402738 DNHD1Q96M86 4753 aa4.09□□□□□ -1.75
HERC3-202ENST00000402738 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.06□□□□□ -1.76
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HERC3-202ENST00000402738 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.99□□□□□ -1.77
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-5P60370 271 aa3.97□□□□□ -1.77
HERC3-202ENST00000402738 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.94□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.93□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.93□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.92□□□□□ -1.78
HERC3-202ENST00000402738 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.91□□□□□ -1.78
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HERC3-202ENST00000402738 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.87□□□□□ -1.79
HERC3-202ENST00000402738 FAT1Q14517 4588 aa3.87□□□□□ -1.79
HERC3-202ENST00000402738 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.87□□□□□ -1.79
HERC3-202ENST00000402738 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.86□□□□□ -1.79
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.84□□□□□ -1.79
HERC3-202ENST00000402738 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
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HERC3-202ENST00000402738 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.79□□□□□ -1.8
HERC3-202ENST00000402738 LYSTQ99698 3801 aa3.77□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.76□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.76□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.74□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.74□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 KMT2AQ03164 3969 aa3.73□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.72□□□□□ -1.81
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.71□□□□□ -1.82
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HERC3-202ENST00000402738 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
HERC3-202ENST00000402738 MT2AP02795 61 aa3.67□□□□□ -1.82
HERC3-202ENST00000402738 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.66□□□□□ -1.82
HERC3-202ENST00000402738 RYR1P21817 5038 aa3.65□□□□□ -1.82
HERC3-202ENST00000402738 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.64□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 RYR3Q15413 4870 aa3.64□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 MT1HP80294 61 aa3.64□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 MT1FP04733 61 aa3.62□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 MYCBP2O75592 4640 aa3.61□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.61□□□□□ -1.83
HERC3-202ENST00000402738 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.59□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.58□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 FRAS1Q86XX4 4008 aa3.57□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 PKD1P98161 4303 aa3.57□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 HSPG2P98160 4391 aa3.56□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP12-4P60329 112 aa3.52□□□□□ -1.85
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.52□□□□□ -1.85
HERC3-202ENST00000402738 HERC2O95714 4834 aa3.49□□□□□ -1.85
HERC3-202ENST00000402738 PKHD1P08F94 4074 aa3.48□□□□□ -1.85
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HERC3-202ENST00000402738 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.45□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 MT1XP80297 61 aa3.44□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.43□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 LCE3BQ5TA77 95 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.42□□□□□ -1.86
HERC3-202ENST00000402738 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.38□□□□□ -1.87
HERC3-202ENST00000402738 MT1GP13640 62 aa3.36□□□□□ -1.87
HERC3-202ENST00000402738 MT1BP07438 61 aa3.35□□□□□ -1.87
HERC3-202ENST00000402738 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.33□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 PCLOQ9Y6V0 5065 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.32□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 TNXBP22105 4242 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 HERC1Q15751 4861 aa3.31□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 LRP2P98164 4655 aa3.3□□□□□ -1.88
HERC3-202ENST00000402738 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.26□□□□□ -1.89
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.23□□□□□ -1.89
HERC3-202ENST00000402738 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.23□□□□□ -1.89
HERC3-202ENST00000402738 MUC17Q685J3 4493 aa3.2□□□□□ -1.9
HERC3-202ENST00000402738 LCE2CQ5TA81 110 aa3.17□□□□□ -1.9
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.14□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 MT1LQ93083 61 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 LPAP08519 4548 aa3.13□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 PRM1P04553 51 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.12□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.11□□□□□ -1.91
HERC3-202ENST00000402738 MT1EP04732 61 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2EP22531 72 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2BP35325 72 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 SPRR2AP35326 72 aa3.06□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.04□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.03□□□□□ -1.92
HERC3-202ENST00000402738 RNF213Q63HN8 5207 aa3.01□□□□□ -1.93
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa2.99□□□□□ -1.93
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