RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 RYR1P21817 5038 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-201ENST00000372616 IGLV7-43P04211 117 aa4.12□□□□□ -1.75
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GVY2 172 aa4.11□□□□□ -1.75
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-1P60331 282 aa4.11□□□□□ -1.75
CTPS1-201ENST00000372616 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.11□□□□□ -1.75
CTPS1-201ENST00000372616 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.09□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 HERC2O95714 4834 aa4.08□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.07□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 PKD1P98161 4303 aa4.07□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 CSAG1Q6PB30 78 aa4.06□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.06□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.06□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.05□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 NDUFAF8A1L188 74 aa4.04□□□□□ -1.76
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.02□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 K7ERS5 55 aa4.02□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.02□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 A8MUU9 505 aa4□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 SPINK1P00995 79 aa4□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.99□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 PKHD1P08F94 4074 aa3.98□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 A0A1B0GU33 70 aa3.97□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.96□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.95□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.95□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.95□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 H0YAA0 97 aa3.94□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 ROMO1P60602 79 aa3.94□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.94□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.94□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.92□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.92□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 Q5VSD8 79 aa3.91□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA13Q86UQ4 5058 aa3.91□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
CTPS1-201ENST00000372616 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.89□□□□□ -1.79
CTPS1-201ENST00000372616 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.88□□□□□ -1.79
CTPS1-201ENST00000372616 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.86□□□□□ -1.79
CTPS1-201ENST00000372616 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.86□□□□□ -1.79
CTPS1-201ENST00000372616 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
CTPS1-201ENST00000372616 HERC1Q15751 4861 aa3.83□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 HSPG2P98160 4391 aa3.82□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 FAT1Q14517 4588 aa3.81□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.81□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-8P60410 259 aa3.8□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 UBR4Q5T4S7 5183 aa3.79□□□□□ -1.8
CTPS1-201ENST00000372616 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.76□□□□□ -1.81
CTPS1-201ENST00000372616 C9orf92A6NGG3 77 aa3.74□□□□□ -1.81
CTPS1-201ENST00000372616 CRIPTQ9P021 101 aa3.74□□□□□ -1.81
CTPS1-201ENST00000372616 MT1HL1P0DM35 61 aa3.73□□□□□ -1.81
CTPS1-201ENST00000372616 P0C880 135 aa3.72□□□□□ -1.81
CTPS1-201ENST00000372616 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.68□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 S4R3F8 94 aa3.68□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 TNXBP22105 4242 aa3.67□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.67□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 TPRXLQ17RH7 258 aa3.65□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.65□□□□□ -1.82
CTPS1-201ENST00000372616 A0A0D9SG42 100 aa3.64□□□□□ -1.83
CTPS1-201ENST00000372616 MYCBP2O75592 4640 aa3.63□□□□□ -1.83
CTPS1-201ENST00000372616 M0QZ58 72 aa3.63□□□□□ -1.83
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.61□□□□□ -1.83
CTPS1-201ENST00000372616 MT3P25713 68 aa3.58□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 LUZP6Q538Z0 58 aa3.57□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 LCE1FQ5T754 118 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP12-1P59990 96 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP12-2P59991 146 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.56□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.54□□□□□ -1.84
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.51□□□□□ -1.85
CTPS1-201ENST00000372616 RNF213Q63HN8 5207 aa3.5□□□□□ -1.85
CTPS1-201ENST00000372616 PP632Q6XCG6 107 aa3.46□□□□□ -1.86
CTPS1-201ENST00000372616 PLAC4Q8WY50 150 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-201ENST00000372616 R4GN34 69 aa3.44□□□□□ -1.86
CTPS1-201ENST00000372616 LRP2P98164 4655 aa3.4□□□□□ -1.87
CTPS1-201ENST00000372616 LPAP08519 4548 aa3.4□□□□□ -1.87
CTPS1-201ENST00000372616 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.34□□□□□ -1.87
CTPS1-201ENST00000372616 MUC17Q685J3 4493 aa3.34□□□□□ -1.87
CTPS1-201ENST00000372616 FAT4Q6V0I7 4981 aa3.32□□□□□ -1.88
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.32□□□□□ -1.88
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP10-12P60413 245 aa3.3□□□□□ -1.88
CTPS1-201ENST00000372616 MUC2Q02817 5179 aa3.27□□□□□ -1.89
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.24□□□□□ -1.89
CTPS1-201ENST00000372616 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.24□□□□□ -1.89
CTPS1-201ENST00000372616 TNP1P09430 55 aa3.22□□□□□ -1.89
CTPS1-201ENST00000372616 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.19□□□□□ -1.9
CTPS1-201ENST00000372616 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.16□□□□□ -1.9
CTPS1-201ENST00000372616 M0R2T5 61 aa3.15□□□□□ -1.9
CTPS1-201ENST00000372616 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.15□□□□□ -1.91
CTPS1-201ENST00000372616 MT1HP80294 61 aa3.14□□□□□ -1.91
CTPS1-201ENST00000372616 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
CTPS1-201ENST00000372616 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.1□□□□□ -1.91
CTPS1-201ENST00000372616 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.09□□□□□ -1.92
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