RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317868.8

ATG4C-201, Transcript of autophagy related 4C cysteine peptidase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ATG4C, Length 2,938 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4C-201ENST00000317868 MYCBP2O75592 4640 aa7.13□□□□□ -1.27
ATG4C-201ENST00000317868 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.11□□□□□ -1.27
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4C-201ENST00000317868 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.09□□□□□ -1.27
ATG4C-201ENST00000317868 A0A1B0GU33 70 aa7.07□□□□□ -1.28
ATG4C-201ENST00000317868 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
ATG4C-201ENST00000317868 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4C-201ENST00000317868 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.28
ATG4C-201ENST00000317868 LPAP08519 4548 aa7□□□□□ -1.29
ATG4C-201ENST00000317868 PRAC1Q96KF2 57 aa7□□□□□ -1.29
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
ATG4C-201ENST00000317868 TPRXLQ17RH7 258 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4C-201ENST00000317868 LRP2P98164 4655 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4C-201ENST00000317868 S4R3F8 94 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4C-201ENST00000317868 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4C-201ENST00000317868 CSAG1Q6PB30 78 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4C-201ENST00000317868 MUC17Q685J3 4493 aa6.82□□□□□ -1.32
ATG4C-201ENST00000317868 P0C880 135 aa6.8□□□□□ -1.32
ATG4C-201ENST00000317868 LINC01554Q52M75 96 aa6.77□□□□□ -1.33
ATG4C-201ENST00000317868 K7ERS5 55 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.72□□□□□ -1.33
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0D9SG42 100 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4C-201ENST00000317868 ROMO1P60602 79 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4C-201ENST00000317868 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 HERC2O95714 4834 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP12-2P59991 146 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 M0QZ58 72 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP12-1P59990 96 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4C-201ENST00000317868 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.53□□□□□ -1.36
ATG4C-201ENST00000317868 CRIPTQ9P021 101 aa6.52□□□□□ -1.37
ATG4C-201ENST00000317868 J3QL48 77 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4C-201ENST00000317868 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4C-201ENST00000317868 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.42□□□□□ -1.38
ATG4C-201ENST00000317868 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
ATG4C-201ENST00000317868 R4GN34 69 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4C-201ENST00000317868 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4C-201ENST00000317868 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.33□□□□□ -1.4
ATG4C-201ENST00000317868 HERC1Q15751 4861 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4C-201ENST00000317868 MUC2Q02817 5179 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4C-201ENST00000317868 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.29□□□□□ -1.4
ATG4C-201ENST00000317868 LCE2CQ5TA81 110 aa6.18□□□□□ -1.42
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.14□□□□□ -1.43
ATG4C-201ENST00000317868 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.05□□□□□ -1.44
ATG4C-201ENST00000317868 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.01□□□□□ -1.45
ATG4C-201ENST00000317868 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6□□□□□ -1.45
ATG4C-201ENST00000317868 RNF213Q63HN8 5207 aa6□□□□□ -1.45
ATG4C-201ENST00000317868 MT1HP80294 61 aa5.98□□□□□ -1.45
ATG4C-201ENST00000317868 PP632Q6XCG6 107 aa5.98□□□□□ -1.45
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.95□□□□□ -1.46
ATG4C-201ENST00000317868 H3BS24 57 aa5.94□□□□□ -1.46
ATG4C-201ENST00000317868 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.92□□□□□ -1.46
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.9□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 PLAC4Q8WY50 150 aa5.86□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 MT2AP02795 61 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 MT1FP04733 61 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 TNP1P09430 55 aa5.85□□□□□ -1.47
ATG4C-201ENST00000317868 NDUFAF8A1L188 74 aa5.81□□□□□ -1.48
ATG4C-201ENST00000317868 M0R2T5 61 aa5.8□□□□□ -1.48
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.77□□□□□ -1.49
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP10-10P60014 251 aa5.73□□□□□ -1.49
ATG4C-201ENST00000317868 MT1BP07438 61 aa5.67□□□□□ -1.5
ATG4C-201ENST00000317868 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.63□□□□□ -1.51
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.61□□□□□ -1.51
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP10-5P60370 271 aa5.6□□□□□ -1.51
ATG4C-201ENST00000317868 MT1XP80297 61 aa5.6□□□□□ -1.51
ATG4C-201ENST00000317868 LCE3AQ5TA76 89 aa5.58□□□□□ -1.52
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.51□□□□□ -1.53
ATG4C-201ENST00000317868 LUZP6Q538Z0 58 aa5.48□□□□□ -1.53
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP10-12P60413 245 aa5.4□□□□□ -1.54
ATG4C-201ENST00000317868 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
ATG4C-201ENST00000317868 LCE2BO14633 110 aa5.38□□□□□ -1.55
ATG4C-201ENST00000317868 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.33□□□□□ -1.56
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP12-3P60328 96 aa5.32□□□□□ -1.56
ATG4C-201ENST00000317868 USH2AO75445 5202 aa5.18□□□□□ -1.58
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.13□□□□□ -1.59
ATG4C-201ENST00000317868 A0A0A0MQY5 61 aa5.13□□□□□ -1.59
ATG4C-201ENST00000317868 KMT2DO14686 5537 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4C-201ENST00000317868 SSPOA2VEC9 5147 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4C-201ENST00000317868 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5□□□□□ -1.61
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.9□□□□□ -1.63
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.86□□□□□ -1.63
ATG4C-201ENST00000317868 MT1EP04732 61 aa4.85□□□□□ -1.63
ATG4C-201ENST00000317868 MT1LQ93083 61 aa4.83□□□□□ -1.64
ATG4C-201ENST00000317868 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
ATG4C-201ENST00000317868 INE1O15225 51 aa4.77□□□□□ -1.65
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.77□□□□□ -1.65
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.77□□□□□ -1.65
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.71□□□□□ -1.66
ATG4C-201ENST00000317868 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 81.7 ms