RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312060.9

CTU2-201, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene CTU2, Length 1,672 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-201ENST00000312060 S4R3F8 94 aa10.88□□□□□ -0.67
CTU2-201ENST00000312060 LCA10Q71F78 164 aa10.84□□□□□ -0.67
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CTU2-201ENST00000312060 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa10.81□□□□□ -0.68
CTU2-201ENST00000312060 MT1HP80294 61 aa10.79□□□□□ -0.68
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.76□□□□□ -0.69
CTU2-201ENST00000312060 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.73□□□□□ -0.69
CTU2-201ENST00000312060 M0R2T5 61 aa10.71□□□□□ -0.69
CTU2-201ENST00000312060 CSAG1Q6PB30 78 aa10.69□□□□□ -0.7
CTU2-201ENST00000312060 SPTSSBQ8NFR3 76 aa10.66□□□□□ -0.7
CTU2-201ENST00000312060 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
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CTU2-201ENST00000312060 Q1T7F1 81 aa10.42□□□□□ -0.74
CTU2-201ENST00000312060 LORP23490 312 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
CTU2-201ENST00000312060 H0YAA0 97 aa10.39□□□□□ -0.75
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CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa10.35□□□□□ -0.75
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CTU2-201ENST00000312060 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.3□□□□□ -0.76
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CTU2-201ENST00000312060 MT1FP04733 61 aa10.22□□□□□ -0.77
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-10P60014 251 aa10.22□□□□□ -0.77
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CTU2-201ENST00000312060 Q5VV11 94 aa10.08□□□□□ -0.8
CTU2-201ENST00000312060 BRK1Q8WUW1 75 aa10.07□□□□□ -0.8
CTU2-201ENST00000312060 CRIPTQ9P021 101 aa10.07□□□□□ -0.8
CTU2-201ENST00000312060 A0A1B0GU33 70 aa10.05□□□□□ -0.8
CTU2-201ENST00000312060 R4GN34 69 aa10.02□□□□□ -0.8
CTU2-201ENST00000312060 M0QZ58 72 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa9.99□□□□□ -0.81
CTU2-201ENST00000312060 A6NED7 52 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2GQ9BYE4 73 aa9.93□□□□□ -0.82
CTU2-201ENST00000312060 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.9□□□□□ -0.83
CTU2-201ENST00000312060 UQCR11O14957 56 aa9.89□□□□□ -0.83
CTU2-201ENST00000312060 LINC01554Q52M75 96 aa9.83□□□□□ -0.84
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CTU2-201ENST00000312060 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
CTU2-201ENST00000312060 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.74□□□□□ -0.85
CTU2-201ENST00000312060 A0A0D9SG42 100 aa9.74□□□□□ -0.85
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa9.71□□□□□ -0.86
CTU2-201ENST00000312060 A8MU10 97 aa9.7□□□□□ -0.86
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CTU2-201ENST00000312060 A6NN06 94 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-201ENST00000312060 MT1BP07438 61 aa9.61□□□□□ -0.87
CTU2-201ENST00000312060 FSIP2Q5CZC0 6907 aa9.57□□□□□ -0.88
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CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa9.55□□□□□ -0.88
CTU2-201ENST00000312060 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.55□□□□□ -0.88
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP12-1P59990 96 aa9.53□□□□□ -0.88
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CTU2-201ENST00000312060 SSPOA2VEC9 5147 aa9.43□□□□□ -0.9
CTU2-201ENST00000312060 K7ERS5 55 aa9.38□□□□□ -0.91
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CTU2-201ENST00000312060 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.34□□□□□ -0.91
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa9.25□□□□□ -0.93
CTU2-201ENST00000312060 MT1XP80297 61 aa9.22□□□□□ -0.93
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-5P60370 271 aa9.2□□□□□ -0.94
CTU2-201ENST00000312060 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.2□□□□□ -0.94
CTU2-201ENST00000312060 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.17□□□□□ -0.94
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CTU2-201ENST00000312060 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.05□□□□□ -0.96
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.93□□□□□ -0.98
CTU2-201ENST00000312060 ROMO1P60602 79 aa8.92□□□□□ -0.98
CTU2-201ENST00000312060 PRAC1Q96KF2 57 aa8.86□□□□□ -0.99
CTU2-201ENST00000312060 TNP1P09430 55 aa8.85□□□□□ -0.99
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
CTU2-201ENST00000312060 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
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CTU2-201ENST00000312060 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.75□□□□□ -1.01
CTU2-201ENST00000312060 KMT2DO14686 5537 aa8.75□□□□□ -1.01
CTU2-201ENST00000312060 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
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CTU2-201ENST00000312060 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.59□□□□□ -1.03
CTU2-201ENST00000312060 LCE3AQ5TA76 89 aa8.51□□□□□ -1.05
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP23-1A1A580 65 aa8.45□□□□□ -1.06
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.44□□□□□ -1.06
CTU2-201ENST00000312060 PP632Q6XCG6 107 aa8.38□□□□□ -1.07
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.27□□□□□ -1.09
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.24□□□□□ -1.09
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa8.21□□□□□ -1.09
CTU2-201ENST00000312060 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.2□□□□□ -1.1
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP5-9P26371 169 aa8.19□□□□□ -1.1
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP12-3P60328 96 aa8.19□□□□□ -1.1
CTU2-201ENST00000312060 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.15□□□□□ -1.1
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa8.14□□□□□ -1.11
CTU2-201ENST00000312060 MT1EP04732 61 aa8.11□□□□□ -1.11
CTU2-201ENST00000312060 MDN1Q9NU22 5596 aa8.01□□□□□ -1.13
CTU2-201ENST00000312060 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.95□□□□□ -1.14
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