RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 RYR1P21817 5038 aa4.63□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.63□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 TNXBP22105 4242 aa4.62□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 UQCR11O14957 56 aa4.62□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 LRP2P98164 4655 aa4.61□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 CRIPTQ9P021 101 aa4.6□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.59□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
GINS1-201ENST00000262460 A8MUU9 505 aa4.58□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 H0YAA0 97 aa4.57□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.57□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-8P60410 259 aa4.57□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 Q5VSD8 79 aa4.57□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 CSAG1Q6PB30 78 aa4.53□□□□□ -1.68
GINS1-201ENST00000262460 A0A0D9SG42 100 aa4.52□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GU33 70 aa4.51□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.5□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.48□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 MUC2Q02817 5179 aa4.47□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 XP32Q5T750 250 aa4.47□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.46□□□□□ -1.69
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.46□□□□□ -1.7
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.44□□□□□ -1.7
GINS1-201ENST00000262460 P0C880 135 aa4.42□□□□□ -1.7
GINS1-201ENST00000262460 MT1HL1P0DM35 61 aa4.4□□□□□ -1.7
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GINS1-201ENST00000262460 LCE2CQ5TA81 110 aa4.38□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 LINC01554Q52M75 96 aa4.38□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 HERC2O95714 4834 aa4.37□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.37□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 S4R3F8 94 aa4.36□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 HERC1Q15751 4861 aa4.35□□□□□ -1.71
GINS1-201ENST00000262460 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.34□□□□□ -1.72
GINS1-201ENST00000262460 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.31□□□□□ -1.72
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP12-2P59991 146 aa4.29□□□□□ -1.72
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.28□□□□□ -1.72
GINS1-201ENST00000262460 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.28□□□□□ -1.72
GINS1-201ENST00000262460 K7ERS5 55 aa4.26□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 TPRXLQ17RH7 258 aa4.23□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.23□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.22□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.22□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 ROMO1P60602 79 aa4.21□□□□□ -1.73
GINS1-201ENST00000262460 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 RNF213Q63HN8 5207 aa4.19□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 MUC17Q685J3 4493 aa4.18□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP12-1P59990 96 aa4.18□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 M0QZ58 72 aa4.16□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.16□□□□□ -1.74
GINS1-201ENST00000262460 R4GN34 69 aa4.1□□□□□ -1.75
GINS1-201ENST00000262460 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.02□□□□□ -1.77
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.98□□□□□ -1.77
GINS1-201ENST00000262460 LUZP6Q538Z0 58 aa3.97□□□□□ -1.77
GINS1-201ENST00000262460 NDUFAF8A1L188 74 aa3.95□□□□□ -1.78
GINS1-201ENST00000262460 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
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GINS1-201ENST00000262460 USH2AO75445 5202 aa3.77□□□□□ -1.81
GINS1-201ENST00000262460 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS1-201ENST00000262460 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.74□□□□□ -1.81
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-10P60014 251 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 MT1HP80294 61 aa3.7□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 MT1FP04733 61 aa3.69□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 KMT2DO14686 5537 aa3.68□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 TNP1P09430 55 aa3.66□□□□□ -1.82
GINS1-201ENST00000262460 MT2AP02795 61 aa3.64□□□□□ -1.83
GINS1-201ENST00000262460 LCE3AQ5TA76 89 aa3.6□□□□□ -1.83
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GINS1-201ENST00000262460 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.49□□□□□ -1.85
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-5P60370 271 aa3.48□□□□□ -1.85
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GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
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GINS1-201ENST00000262460 LCE3BQ5TA77 95 aa3.45□□□□□ -1.86
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.42□□□□□ -1.86
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.4□□□□□ -1.87
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-12P60413 245 aa3.39□□□□□ -1.87
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.37□□□□□ -1.87
GINS1-201ENST00000262460 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.36□□□□□ -1.87
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GINS1-201ENST00000262460 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.32□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 LCE4AQ5TA78 99 aa3.32□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.32□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.32□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.31□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.3□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 SSPOA2VEC9 5147 aa3.29□□□□□ -1.88
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.27□□□□□ -1.89
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