RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258083.2

PRADC1-201, Transcript of protease associated domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRADC1, Length 1,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRADC1-201ENST00000258083 A0A087WVE0 104 aa10□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 MT1BP07438 61 aa10□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 SCGB1A1P11684 91 aa10□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa10□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 ATOX1O00244 68 aa9.98□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 KLKP1Q107X0 134 aa9.97□□□□□ -0.81
PRADC1-201ENST00000258083 H0Y9P7 68 aa9.96□□□□□ -0.82
PRADC1-201ENST00000258083 Q5VV11 94 aa9.93□□□□□ -0.82
PRADC1-201ENST00000258083 IMUPQ9GZP8 106 aa9.93□□□□□ -0.82
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa9.86□□□□□ -0.83
PRADC1-201ENST00000258083 CRIPTQ9P021 101 aa9.85□□□□□ -0.83
PRADC1-201ENST00000258083 PCP4P48539 62 aa9.84□□□□□ -0.83
PRADC1-201ENST00000258083 A6NN06 94 aa9.83□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 A8MUN3 132 aa9.83□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 OCR1Q9BZK8 76 aa9.83□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 H0YAA0 97 aa9.81□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 NDUFC1O43677 76 aa9.81□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 LINC00208Q96KT6 92 aa9.8□□□□□ -0.84
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP10-5P60370 271 aa9.77□□□□□ -0.85
PRADC1-201ENST00000258083 MP68P56378 58 aa9.74□□□□□ -0.85
PRADC1-201ENST00000258083 ANAPC13Q9BS18 74 aa9.66□□□□□ -0.86
PRADC1-201ENST00000258083 H3BPC8 53 aa9.64□□□□□ -0.87
PRADC1-201ENST00000258083 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.62□□□□□ -0.87
PRADC1-201ENST00000258083 MUC12Q9UKN1 5478 aa9.6□□□□□ -0.87
PRADC1-201ENST00000258083 NEBP20929 6669 aa9.56□□□□□ -0.88
PRADC1-201ENST00000258083 DMAC1Q96GE9 116 aa9.55□□□□□ -0.88
PRADC1-201ENST00000258083 SMIM20Q8N5G0 67 aa9.51□□□□□ -0.89
PRADC1-201ENST00000258083 SERP2Q8N6R1 65 aa9.49□□□□□ -0.89
PRADC1-201ENST00000258083 COX7CP15954 63 aa9.48□□□□□ -0.89
PRADC1-201ENST00000258083 TRAV7A0A075B6U4 112 aa9.44□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 CCDC179H3BU77 68 aa9.44□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 P0C880 135 aa9.44□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP5-9P26371 169 aa9.44□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 KMT2DO14686 5537 aa9.42□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 C20orf197Q8N268 126 aa9.4□□□□□ -0.9
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.39□□□□□ -0.91
PRADC1-201ENST00000258083 R4GN34 69 aa9.38□□□□□ -0.91
PRADC1-201ENST00000258083 MT1XP80297 61 aa9.37□□□□□ -0.91
PRADC1-201ENST00000258083 MDN1Q9NU22 5596 aa9.35□□□□□ -0.91
PRADC1-201ENST00000258083 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.34□□□□□ -0.91
PRADC1-201ENST00000258083 PLAC4Q8WY50 150 aa9.32□□□□□ -0.92
PRADC1-201ENST00000258083 M0QZ58 72 aa9.3□□□□□ -0.92
PRADC1-201ENST00000258083 ACYP2P14621 99 aa9.26□□□□□ -0.93
PRADC1-201ENST00000258083 CYSTM1Q9H1C7 97 aa9.18□□□□□ -0.94
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP12-2P59991 146 aa9.17□□□□□ -0.94
PRADC1-201ENST00000258083 SNURFQ9Y675 71 aa9.15□□□□□ -0.94
PRADC1-201ENST00000258083 TMEM258P61165 79 aa9.14□□□□□ -0.95
PRADC1-201ENST00000258083 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.14□□□□□ -0.95
PRADC1-201ENST00000258083 LINC01554Q52M75 96 aa9.13□□□□□ -0.95
PRADC1-201ENST00000258083 H7BZZ5 65 aa9.11□□□□□ -0.95
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa9.09□□□□□ -0.95
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR2FQ96RM1 72 aa9.07□□□□□ -0.96
PRADC1-201ENST00000258083 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.04□□□□□ -0.96
PRADC1-201ENST00000258083 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.04□□□□□ -0.96
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa9.03□□□□□ -0.96
PRADC1-201ENST00000258083 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.95□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.95□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR2EP22531 72 aa8.93□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR2BP35325 72 aa8.93□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR2AP35326 72 aa8.93□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP10-12P60413 245 aa8.91□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 RPS28P62857 69 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.88□□□□□ -0.99
PRADC1-201ENST00000258083 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.88□□□□□ -0.99
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.88□□□□□ -0.99
PRADC1-201ENST00000258083 SERP1Q9Y6X1 66 aa8.86□□□□□ -0.99
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.82□□□□□ -1
PRADC1-201ENST00000258083 COA5Q86WW8 74 aa8.75□□□□□ -1.01
PRADC1-201ENST00000258083 SMIM26A0A096LP01 95 aa8.64□□□□□ -1.03
PRADC1-201ENST00000258083 SPRR2DP22532 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.6□□□□□ -1.03
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.6□□□□□ -1.03
PRADC1-201ENST00000258083 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.59□□□□□ -1.03
PRADC1-201ENST00000258083 SEC61GP60059 68 aa8.56□□□□□ -1.04
PRADC1-201ENST00000258083 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.47□□□□□ -1.05
PRADC1-201ENST00000258083 A0A0D9SG42 100 aa8.46□□□□□ -1.06
PRADC1-201ENST00000258083 A0A1B0GU33 70 aa8.46□□□□□ -1.06
PRADC1-201ENST00000258083 Q1T7F1 81 aa8.45□□□□□ -1.06
PRADC1-201ENST00000258083 V9GYY9 64 aa8.43□□□□□ -1.06
PRADC1-201ENST00000258083 LCE3BQ5TA77 95 aa8.42□□□□□ -1.06
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa8.39□□□□□ -1.07
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP12-1P59990 96 aa8.37□□□□□ -1.07
PRADC1-201ENST00000258083 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.35□□□□□ -1.07
PRADC1-201ENST00000258083 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.32□□□□□ -1.08
PRADC1-201ENST00000258083 MT1EP04732 61 aa8.3□□□□□ -1.08
PRADC1-201ENST00000258083 A0A1B0GU69 56 aa8.28□□□□□ -1.08
PRADC1-201ENST00000258083 LCE5AQ5TCM9 118 aa8.28□□□□□ -1.08
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa8.23□□□□□ -1.09
PRADC1-201ENST00000258083 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
PRADC1-201ENST00000258083 PRR15LQ9BU68 103 aa8.21□□□□□ -1.1
PRADC1-201ENST00000258083 PSPHP1O15172 72 aa8.2□□□□□ -1.1
PRADC1-201ENST00000258083 A8MU10 97 aa8.16□□□□□ -1.1
PRADC1-201ENST00000258083 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.12□□□□□ -1.11
PRADC1-201ENST00000258083 MT1GP13640 62 aa8.04□□□□□ -1.12
PRADC1-201ENST00000258083 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.01□□□□□ -1.13
PRADC1-201ENST00000258083 A6NED7 52 aa7.98□□□□□ -1.13
PRADC1-201ENST00000258083 BRK1Q8WUW1 75 aa7.98□□□□□ -1.13
PRADC1-201ENST00000258083 TNP1P09430 55 aa7.95□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 142.8 ms