RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 CCDC179H3BU77 68 aa8.02□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 KMT2DO14686 5537 aa8.01□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.99□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 hDV103S1A0JD37 113 aa7.98□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.98□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.97□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 C8orf87E5RJ46 101 aa7.97□□□□□ -1.13
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.96□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.96□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.96□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 OCR1Q9BZK8 76 aa7.96□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-9P26371 169 aa7.95□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.93□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 C20orf197Q8N268 126 aa7.92□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 HRES1P13985 223 aa7.91□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00313P59037 77 aa7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 C5orf47Q569G3 176 aa7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.9□□□□□ -1.14
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFS5O43920 106 aa7.89□□□□□ -1.15
SPCS1-201ENST00000233025 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.89□□□□□ -1.15
SPCS1-201ENST00000233025 MP68P56378 58 aa7.88□□□□□ -1.15
SPCS1-201ENST00000233025 KLKP1Q107X0 134 aa7.86□□□□□ -1.15
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFC1O43677 76 aa7.85□□□□□ -1.15
SPCS1-201ENST00000233025 H3BPC8 53 aa7.83□□□□□ -1.16
SPCS1-201ENST00000233025 SNURFQ9Y675 71 aa7.83□□□□□ -1.16
SPCS1-201ENST00000233025 H0Y9P7 68 aa7.82□□□□□ -1.16
SPCS1-201ENST00000233025 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.81□□□□□ -1.16
SPCS1-201ENST00000233025 TMEM258P61165 79 aa7.79□□□□□ -1.16
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.77□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 LINC00208Q96KT6 92 aa7.77□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 A6NN06 94 aa7.76□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.74□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.74□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 H7BZZ5 65 aa7.73□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.73□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
SPCS1-201ENST00000233025 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.7□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.68□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 SPINK7P58062 85 aa7.65□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.65□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.65□□□□□ -1.18
SPCS1-201ENST00000233025 Q5W150 140 aa7.62□□□□□ -1.19
SPCS1-201ENST00000233025 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.58□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 MT1BP07438 61 aa7.57□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-5P60370 271 aa7.56□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.56□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.56□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2-30P06310 120 aa7.55□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2EP22531 72 aa7.55□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2BP35325 72 aa7.55□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2AP35326 72 aa7.55□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.53□□□□□ -1.2
SPCS1-201ENST00000233025 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa7.52□□□□□ -1.21
SPCS1-201ENST00000233025 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.51□□□□□ -1.21
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.46□□□□□ -1.22
SPCS1-201ENST00000233025 Q5VV11 94 aa7.44□□□□□ -1.22
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.4□□□□□ -1.22
SPCS1-201ENST00000233025 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.4□□□□□ -1.22
SPCS1-201ENST00000233025 ACYP2P14621 99 aa7.39□□□□□ -1.23
SPCS1-201ENST00000233025 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.37□□□□□ -1.23
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.37□□□□□ -1.23
SPCS1-201ENST00000233025 COA5Q86WW8 74 aa7.35□□□□□ -1.23
SPCS1-201ENST00000233025 DMAC1Q96GE9 116 aa7.35□□□□□ -1.23
SPCS1-201ENST00000233025 A8MUN3 132 aa7.32□□□□□ -1.24
SPCS1-201ENST00000233025 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.31□□□□□ -1.24
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2DP22532 72 aa7.31□□□□□ -1.24
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.29□□□□□ -1.24
SPCS1-201ENST00000233025 C4orf26Q17RF5 130 aa7.28□□□□□ -1.24
SPCS1-201ENST00000233025 V9GYY9 64 aa7.25□□□□□ -1.25
SPCS1-201ENST00000233025 SPTSSBQ8NFR3 76 aa7.19□□□□□ -1.26
SPCS1-201ENST00000233025 Q1T7F1 81 aa7.18□□□□□ -1.26
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.13□□□□□ -1.27
SPCS1-201ENST00000233025 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.09□□□□□ -1.27
SPCS1-201ENST00000233025 S4R3F8 94 aa7.08□□□□□ -1.28
SPCS1-201ENST00000233025 LCA10Q71F78 164 aa7.06□□□□□ -1.28
SPCS1-201ENST00000233025 PRR15LQ9BU68 103 aa7.06□□□□□ -1.28
SPCS1-201ENST00000233025 PSPHP1O15172 72 aa7.04□□□□□ -1.28
SPCS1-201ENST00000233025 CSAG1Q6PB30 78 aa7.03□□□□□ -1.28
SPCS1-201ENST00000233025 SEC61GP60059 68 aa7.01□□□□□ -1.29
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GU69 56 aa7□□□□□ -1.29
SPCS1-201ENST00000233025 A6NED7 52 aa6.88□□□□□ -1.31
SPCS1-201ENST00000233025 MT1XP80297 61 aa6.88□□□□□ -1.31
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP12-2P59991 146 aa6.87□□□□□ -1.31
SPCS1-201ENST00000233025 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.86□□□□□ -1.31
SPCS1-201ENST00000233025 BRK1Q8WUW1 75 aa6.85□□□□□ -1.31
SPCS1-201ENST00000233025 CRIPTQ9P021 101 aa6.83□□□□□ -1.32
SPCS1-201ENST00000233025 UQCR11O14957 56 aa6.8□□□□□ -1.32
SPCS1-201ENST00000233025 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.8□□□□□ -1.32
SPCS1-201ENST00000233025 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.79□□□□□ -1.32
SPCS1-201ENST00000233025 A0A1B0GU33 70 aa6.74□□□□□ -1.33
SPCS1-201ENST00000233025 H0YAA0 97 aa6.74□□□□□ -1.33
SPCS1-201ENST00000233025 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.74□□□□□ -1.33
SPCS1-201ENST00000233025 PRO0628Q9UI54 55 aa6.73□□□□□ -1.33
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