RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641145.1

NFIC-211, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

BASIC

Gene NFIC, Length 8,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-211ENST00000641145 FRYLO94915 3013 aa8.82□□□□□ -1
NFIC-211ENST00000641145 LRBAP50851 2863 aa8.79□□□□□ -1
NFIC-211ENST00000641145 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.78□□□□□ -1
NFIC-211ENST00000641145 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.77□□□□□ -1
NFIC-211ENST00000641145 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.77□□□□□ -1.01
NFIC-211ENST00000641145 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
NFIC-211ENST00000641145 VCANP13611 3396 aa8.75□□□□□ -1.01
NFIC-211ENST00000641145 TACC2O95359 2948 aa8.74□□□□□ -1.01
NFIC-211ENST00000641145 ITPR1Q14643 2758 aa8.71□□□□□ -1.01
NFIC-211ENST00000641145 USP34Q70CQ2 3546 aa8.66□□□□□ -1.02
NFIC-211ENST00000641145 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.61□□□□□ -1.03
NFIC-211ENST00000641145 COL6A3P12111 3177 aa8.61□□□□□ -1.03
NFIC-211ENST00000641145 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NFIC-211ENST00000641145 XP32Q5T750 250 aa8.58□□□□□ -1.04
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.54□□□□□ -1.04
NFIC-211ENST00000641145 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.53□□□□□ -1.04
NFIC-211ENST00000641145 H0YAA0 97 aa8.52□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.51□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 SZT2Q5T011 3432 aa8.51□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 SPEGQ15772 3267 aa8.5□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 FLNCQ14315 2725 aa8.48□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 TPRXLQ17RH7 258 aa8.48□□□□□ -1.05
NFIC-211ENST00000641145 ZZEF1O43149 2961 aa8.45□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 TENM3Q9P273 2699 aa8.45□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 COL12A1Q99715 3063 aa8.44□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.42□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 TENM1Q9UKZ4 2725 aa8.41□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.4□□□□□ -1.06
NFIC-211ENST00000641145 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.4□□□□□ -1.07
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP12-2P59991 146 aa8.34□□□□□ -1.07
NFIC-211ENST00000641145 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.33□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.3□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 HIVEP1P15822 2718 aa8.3□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 ATMQ13315 3056 aa8.28□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 EYSQ5T1H1 3165 aa8.28□□□□□ -1.08
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.26□□□□□ -1.09
NFIC-211ENST00000641145 MYO15AQ9UKN7 3530 aa8.23□□□□□ -1.09
NFIC-211ENST00000641145 ZANQ9Y493 2812 aa8.22□□□□□ -1.09
NFIC-211ENST00000641145 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.21□□□□□ -1.1
NFIC-211ENST00000641145 NF1P21359 2839 aa8.19□□□□□ -1.1
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.19□□□□□ -1.1
NFIC-211ENST00000641145 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.18□□□□□ -1.13e-6■■■□□ 16.4
NFIC-211ENST00000641145 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.15□□□□□ -1.1
NFIC-211ENST00000641145 TGP01266 2768 aa8.15□□□□□ -1.1
NFIC-211ENST00000641145 FBN2P35556 2912 aa8.14□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.13□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.13□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.12□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.12□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.1□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 PDZD2O15018 2839 aa8.09□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
NFIC-211ENST00000641145 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.06□□□□□ -1.12
NFIC-211ENST00000641145 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa8.03□□□□□ -1.12
NFIC-211ENST00000641145 TENM4Q6N022 2769 aa7.93□□□□□ -1.14
NFIC-211ENST00000641145 LAMA5O15230 3695 aa7.92□□□□□ -1.14
NFIC-211ENST00000641145 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.91□□□□□ -1.14
NFIC-211ENST00000641145 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.91□□□□□ -1.14
NFIC-211ENST00000641145 INE1O15225 51 aa7.89□□□□□ -1.15
NFIC-211ENST00000641145 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.81□□□□□ -1.16
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP12-1P59990 96 aa7.8□□□□□ -1.16
NFIC-211ENST00000641145 VWFP04275 2813 aa7.77□□□□□ -1.17
NFIC-211ENST00000641145 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.72□□□□□ -1.17
NFIC-211ENST00000641145 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.71□□□□□ -1.18
NFIC-211ENST00000641145 RELNP78509 3460 aa7.7□□□□□ -1.18
NFIC-211ENST00000641145 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.19
NFIC-211ENST00000641145 DMDP11532 3685 aa7.63□□□□□ -1.19
NFIC-211ENST00000641145 ZFHX3Q15911 3703 aa7.6□□□□□ -1.19
NFIC-211ENST00000641145 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NFIC-211ENST00000641145 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
NFIC-211ENST00000641145 TENM2Q9NT68 2774 aa7.57□□□□□ -1.2
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-12P60413 245 aa7.56□□□□□ -1.2
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
NFIC-211ENST00000641145 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.41□□□□□ -1.22
NFIC-211ENST00000641145 COL7A1Q02388 2944 aa7.39□□□□□ -1.23
NFIC-211ENST00000641145 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.38□□□□□ -1.23
NFIC-211ENST00000641145 CUBNO60494 3623 aa7.35□□□□□ -1.23
NFIC-211ENST00000641145 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP10-5P60370 271 aa7.3□□□□□ -1.24
NFIC-211ENST00000641145 VPS13CQ709C8 3753 aa7.28□□□□□ -1.24
NFIC-211ENST00000641145 MUC3AQ02505 3323 aa7.27□□□□□ -1.25
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP12-3P60328 96 aa7.25□□□□□ -1.25
NFIC-211ENST00000641145 BSNQ9UPA5 3926 aa7.23□□□□□ -1.25
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.21□□□□□ -1.26
NFIC-211ENST00000641145 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.18□□□□□ -1.26
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.12□□□□□ -1.27
NFIC-211ENST00000641145 FBN3Q75N90 2809 aa7.1□□□□□ -1.27
NFIC-211ENST00000641145 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.07□□□□□ -1.28
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.06□□□□□ -1.28
NFIC-211ENST00000641145 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.04□□□□□ -1.28
NFIC-211ENST00000641145 LCE3AQ5TA76 89 aa7.02□□□□□ -1.29
NFIC-211ENST00000641145 AKAP9Q99996 3911 aa7.01□□□□□ -1.29
NFIC-211ENST00000641145 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.98□□□□□ -1.29
NFIC-211ENST00000641145 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.73□□□□□ -1.33
NFIC-211ENST00000641145 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
NFIC-211ENST00000641145 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.72□□□□□ -1.33
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