RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TRIAP1O43715 76 aa12.92□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.92□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BQ85 93 aa12.91□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf144Q96I85 54 aa12.9□□□□□ -0.34
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.87□□□□□ -0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 HIGD1BQ9P298 99 aa12.87□□□□□ -0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa12.85□□□□□ -0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NJY4 79 aa12.85□□□□□ -0.35
CAPNS1-217ENST00000629983 CEND1Q8N111 149 aa12.83□□□□□ -0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 MUC12Q9UKN1 5478 aa12.82□□□□□ -0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 J3KT08 172 aa12.81□□□□□ -0.36
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A6P06703 90 aa12.81□□□□□ -0.36
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CAPNS1-217ENST00000629983 C2orf91Q6ZV80 131 aa12.79□□□□□ -0.36
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CAPNS1-217ENST00000629983 PAM16Q9Y3D7 125 aa12.77□□□□□ -0.37
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CAPNS1-217ENST00000629983 UBE2V1Q13404 147 aa12.75□□□□□ -0.37
CAPNS1-217ENST00000629983 SPATA45Q537H7 98 aa12.75□□□□□ -0.37
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CAPNS1-217ENST00000629983 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.7□□□□□ -0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa12.67□□□□□ -0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 A6NN06 94 aa12.67□□□□□ -0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa12.66□□□□□ -0.38
CAPNS1-217ENST00000629983 VAMP8Q9BV40 100 aa12.64□□□□□ -0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 K7ERJ3 54 aa12.63□□□□□ -0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 Q6ZQT0 140 aa12.61□□□□□ -0.39
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CAPNS1-217ENST00000629983 C9JAW5 83 aa12.59□□□□□ -0.39
CAPNS1-217ENST00000629983 SMIM6P0DI80 62 aa12.54□□□□□ -0.4
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa12.48□□□□□ -0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa12.48□□□□□ -0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.48□□□□□ -0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD52Q0P140 79 aa12.48□□□□□ -0.41
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa12.45□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV2-30P06310 120 aa12.45□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 Q5VV11 94 aa12.45□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 NDUFS5O43920 106 aa12.44□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.44□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MT1BP07438 61 aa12.42□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR15Q8IV56 129 aa12.42□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM254Q8TBM7 123 aa12.42□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MDN1Q9NU22 5596 aa12.41□□□□□ -0.42
CAPNS1-217ENST00000629983 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa12.38□□□□□ -0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 C7orf65Q6ZTY9 151 aa12.36□□□□□ -0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 KMT2DO14686 5537 aa12.36□□□□□ -0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 C5orf47Q569G3 176 aa12.35□□□□□ -0.43
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GW54 56 aa12.33□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 hDV103S1A0JD37 113 aa12.32□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP5-9P26371 169 aa12.32□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP10-5P60370 271 aa12.3□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.29□□□□□ -0.44
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CAPNS1-217ENST00000629983 PYY3Q5JQD4 70 aa12.29□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.28□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 PCP4L1A6NKN8 68 aa12.28□□□□□ -0.44
CAPNS1-217ENST00000629983 C4orf26Q17RF5 130 aa12.27□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa12.27□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 PDE6GP18545 87 aa12.23□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 Q5W150 140 aa12.22□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2GQ9BYE4 73 aa12.22□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 K7EQZ3 153 aa12.21□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.21□□□□□ -0.45
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN8Q156A1 80 aa12.19□□□□□ -0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 TSTD3H0UI37 97 aa12.15□□□□□ -0.46
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa12.14□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa12.14□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 S4R3F8 94 aa12.14□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 IMUPQ9GZP8 106 aa12.13□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 CSAG1Q6PB30 78 aa12.12□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.1□□□□□ -0.47
CAPNS1-217ENST00000629983 HCG22E2RYF7 251 aa12.05□□□□□ -0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CAPNS1-217ENST00000629983 KLKP1Q107X0 134 aa12.02□□□□□ -0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 LCA10Q71F78 164 aa12.01□□□□□ -0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 BPY2O14599 106 aa12□□□□□ -0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 CASC2Q6XLA1 102 aa11.99□□□□□ -0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa11.98□□□□□ -0.49
CAPNS1-217ENST00000629983 C1orf64Q8NEQ6 169 aa11.94□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 CXCL6P80162 114 aa11.93□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 Q8N9L7 120 aa11.92□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2EP22531 72 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2BP35325 72 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2AP35326 72 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 SPRR2FQ96RM1 72 aa11.91□□□□□ -0.5
CAPNS1-217ENST00000629983 M0R143 59 aa11.85□□□□□ -0.51
CAPNS1-217ENST00000629983 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP11.81□□□□□ -0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 CRIPTQ9P021 101 aa11.78□□□□□ -0.52
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa11.71□□□□□ -0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa11.71□□□□□ -0.53
CAPNS1-217ENST00000629983 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa11.69□□□□□ -0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.69□□□□□ -0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1B0GV90 55 aa11.68□□□□□ -0.54
CAPNS1-217ENST00000629983 H3BT86 120 aa11.64□□□□□ -0.55
CAPNS1-217ENST00000629983 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa11.62□□□□□ -0.55
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