RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM168B	A1KXE4	195 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.55	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	COA5	Q86WW8	74 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495		H0Y9J4	135 aa		4.54	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8NDZ9	215 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.53	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL37AP8	A6NKH3	93 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	PKD1	P98161	4303 aa		4.52	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	DSCR10	P59022	87 aa		4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK7	P58062	85 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PNN7	141 aa		4.5	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495		K7EQZ3	153 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495		Q5VSD8	79 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495		H0Y9P7	68 aa		4.49	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	RYR1	P21817	5038 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	MYCBP2	O75592	4640 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.48	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8NBF4	154 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.47	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.46	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.46	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.46	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	4.46	□□□□□ -1.69
LETMD1-238	ENST00000623495	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	HERC2	O95714	4834 aa		4.46	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.45	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1W2PNM2	257 aa		4.45	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.45	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	HSPG2	P98160	4391 aa		4.43	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	PRLH	P81277	87 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N377	158 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N1X5	172 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.42	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.41	□□□□□ -1.7
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZSA8	131 aa		4.4	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	CSAG1	Q6PB30	78 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.39	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.38	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	HERC1	Q15751	4861 aa		4.37	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	HRES1	P13985	223 aa		4.36	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	ROMO1	P60602	79 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.35	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.34	□□□□□ -1.71
LETMD1-238	ENST00000623495	REG3G	Q6UW15	175 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.33	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZRX8	168 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MWP4	228 aa		4.32	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.3	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.3	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	UQCR11	O14957	56 aa		4.29	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GU69	56 aa		4.28	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF861P	O60384	105 aa		4.28	□□□□□ -1.72
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.27	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WSZ3	146 aa		4.27	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.27	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.27	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	SPRR1A	P35321	89 aa		4.27	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.26	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.26	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	ACYP2	P14621	99 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.25	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		4.23	□□□□□ -1.73
LETMD1-238	ENST00000623495		P0C880	135 aa		4.19	□□□□□ -1.74
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP2	P98164	4655 aa		4.18	□□□□□ -1.74

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