RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 PLAC8Q9NZF1 115 aa9.27□□□□□ -0.92
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa9.25□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 CRIPTQ9P021 101 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa9.24□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 A0A087X002 238 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 SVEP1Q4LDE5 3571 aa9.22□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 A0A1B0GU33 70 aa9.21□□□□□ -0.93
PTPRT-210ENST00000617474 LINC01554Q52M75 96 aa9.21□□□□□ -0.94
PTPRT-210ENST00000617474 A8MU10 97 aa9.18□□□□□ -0.94
PTPRT-210ENST00000617474 TENM3Q9P273 2699 aa9.16□□□□□ -0.94
PTPRT-210ENST00000617474 CSAG1Q6PB30 78 aa9.14□□□□□ -0.95
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZR54 194 aa9.12□□□□□ -0.95
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-2P60368 255 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRT-210ENST00000617474 PDZD2O15018 2839 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRT-210ENST00000617474 DMAC1Q96GE9 116 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-210ENST00000617474 LCE6AA0A183 80 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00483Q53H64 154 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-1P60331 282 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRT-210ENST00000617474 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.02□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 TENM1Q9UKZ4 2725 aa9.01□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 VWFP04275 2813 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 H3BS24 57 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 J3QL48 77 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRT-210ENST00000617474 OTOGQ6ZRI0 2925 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 CSMD2Q7Z408 3487 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 A6NN06 94 aa8.9□□□□□ -0.98
PTPRT-210ENST00000617474 Q6ZSA8 131 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRT-210ENST00000617474 ZFHX3Q15911 3703 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRT-210ENST00000617474 TGP01266 2768 aa8.83□□□□□ -1
PTPRT-210ENST00000617474 S4R3F8 94 aa8.81□□□□□ -1
PTPRT-210ENST00000617474 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa8.81□□□□□ -1
PTPRT-210ENST00000617474 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.79□□□□□ -1
PTPRT-210ENST00000617474 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRT-210ENST00000617474 TENM2Q9NT68 2774 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRT-210ENST00000617474 BSNQ9UPA5 3926 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRT-210ENST00000617474 ROMO1P60602 79 aa8.71□□□□□ -1.01
PTPRT-210ENST00000617474 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-210ENST00000617474 LUZP6Q538Z0 58 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRT-210ENST00000617474 R4GN34 69 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRT-210ENST00000617474 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRT-210ENST00000617474 Q5VSD8 79 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRT-210ENST00000617474 M0QZ58 72 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRT-210ENST00000617474 FBN3Q75N90 2809 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRT-210ENST00000617474 M0R2T5 61 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-210ENST00000617474 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRT-210ENST00000617474 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRT-210ENST00000617474 VPS13CQ709C8 3753 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-210ENST00000617474 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRT-210ENST00000617474 A8MUU9 505 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRT-210ENST00000617474 NDUFAF8A1L188 74 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 H0YAA0 97 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 COL7A1Q02388 2944 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 A0A0A0MQY5 61 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRT-210ENST00000617474 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRT-210ENST00000617474 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRT-210ENST00000617474 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRT-210ENST00000617474 XP32Q5T750 250 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRT-210ENST00000617474 P0C880 135 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRT-210ENST00000617474 PLAC4Q8WY50 150 aa8.01□□□□□ -1.13
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRT-210ENST00000617474 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-8P60410 259 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-210ENST00000617474 TNP1P09430 55 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRT-210ENST00000617474 A0A1B0GVY2 172 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP12-2P59991 146 aa7.74□□□□□ -1.17
PTPRT-210ENST00000617474 TPRXLQ17RH7 258 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRT-210ENST00000617474 AKAP9Q99996 3911 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRT-210ENST00000617474 PP632Q6XCG6 107 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP12-1P59990 96 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRT-210ENST00000617474 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-10P60014 251 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-210ENST00000617474 DNHD1Q96M86 4753 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRT-210ENST00000617474 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRT-210ENST00000617474 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-210ENST00000617474 MT1HL1P0DM35 61 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.14□□□□□ -1.27
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