RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592170.5

SEH1L-209, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 5

Gene SEH1L, Length 787 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-209ENST00000592170 CD164Q04900 197 aa6.09□□□□□ -1.43
SEH1L-209ENST00000592170 J3QR89 54 aa6.08□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 A0A087WSZ3 146 aa6.07□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 MT1HL1P0DM35 61 aa6.07□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.06□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GW54 56 aa6.06□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.06□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 RNF213Q63HN8 5207 aa6.06□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 K7ERU9 68 aa6.05□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 SPINK1P00995 79 aa6.05□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 ACYP1P07311 99 aa6.04□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00846Q9NV44 126 aa6.04□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 SVIPQ8NHG7 77 aa6.03□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.03□□□□□ -1.44
SEH1L-209ENST00000592170 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.02□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 LIMD2Q9BT23 127 aa6.02□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 Q5XG85 94 aa6.01□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 NREPQ16612 68 aa6□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 Q6ZVQ6 151 aa6□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 UBL5Q9BZL1 73 aa6□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.99□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 LRP2P98164 4655 aa5.98□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 Q96NJ1 140 aa5.98□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.97□□□□□ -1.45
SEH1L-209ENST00000592170 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.96□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 C1orf195Q5TG92 126 aa5.96□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 BPY2O14599 106 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV4-1P06312 121 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00643Q86TS7 51 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 SIGMAR1Q99720 223 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 RETNLBQ9BQ08 111 aa5.93□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 J3KT08 172 aa5.92□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.91□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.9□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 DSCR10P59022 87 aa5.9□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 CXCL6P80162 114 aa5.9□□□□□ -1.46
SEH1L-209ENST00000592170 A8MWP4 228 aa5.88□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 K7EQZ3 153 aa5.87□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 Q8N9L7 120 aa5.87□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 A0A1B0GVX0 72 aa5.86□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFB1O75438 58 aa5.86□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 MT-ATP8P03928 68 aa5.86□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 PRR15Q8IV56 129 aa5.85□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.84□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 PRR4Q16378 134 aa5.84□□□□□ -1.47
SEH1L-209ENST00000592170 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.83□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 C8orf87E5RJ46 101 aa5.81□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.81□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 A0A087WVE0 104 aa5.8□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.8□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 LINC00313P59037 77 aa5.8□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.8□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 C9orf92A6NGG3 77 aa5.79□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 IMUPQ9GZP8 106 aa5.79□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 HCG22E2RYF7 251 aa5.78□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.78□□□□□ -1.48
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.77□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.77□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 hDV103S1A0JD37 113 aa5.76□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 CASC2Q6XLA1 102 aa5.76□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.75□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 TPRXLQ17RH7 258 aa5.75□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.75□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 A0A0U1RQV1 116 aa5.73□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.73□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 LPAP08519 4548 aa5.73□□□□□ -1.49
SEH1L-209ENST00000592170 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.71□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.71□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.69□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 A8MUU9 505 aa5.68□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 NDUFS5O43920 106 aa5.68□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 MUC2Q02817 5179 aa5.67□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 SCGB1A1P11684 91 aa5.67□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 Q75L30 129 aa5.67□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
SEH1L-209ENST00000592170 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.63□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 ATOX1O00244 68 aa5.63□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 MUC17Q685J3 4493 aa5.62□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 OCR1Q9BZK8 76 aa5.62□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.62□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 UQCRQO14949 82 aa5.6□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.6□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 IGKV2-30P06310 120 aa5.59□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.59□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.59□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.59□□□□□ -1.51
SEH1L-209ENST00000592170 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.58□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 Q5W150 140 aa5.58□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.56□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.56□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 PCOTHQ58A44 107 aa5.56□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 H0Y9P7 68 aa5.55□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 SERP2Q8N6R1 65 aa5.55□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 C5orf47Q569G3 176 aa5.53□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.53□□□□□ -1.52
SEH1L-209ENST00000592170 MP68P56378 58 aa5.52□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 606.7 ms