RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584229.1

GPS1-223, Transcript of G protein pathway suppressor 1, human

TSL 3

Gene GPS1, Length 535 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GPS1-223	ENST00000584229	PCOTH	Q58A44	107 aa		13.44	□□□□□ -0.26
GPS1-223	ENST00000584229	ETDB	Q3ZM63	59 aa		13.43	□□□□□ -0.26
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GVX0	72 aa		13.41	□□□□□ -0.26
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFB1	O75438	58 aa		13.4	□□□□□ -0.26
GPS1-223	ENST00000584229		A0A1B0GV90	55 aa		13.39	□□□□□ -0.27
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf87	E5RJ46	101 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GPS1-223	ENST00000584229		Q75L30	129 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GPS1-223	ENST00000584229	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		13.35	□□□□□ -0.27
GPS1-223	ENST00000584229		A8MWP4	228 aa		13.34	□□□□□ -0.27
GPS1-223	ENST00000584229	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229		Q6ZVQ6	151 aa		13.32	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	MUC2	Q02817	5179 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	BPY2	O14599	106 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		13.3	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		13.29	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229		A0A0U1RQV1	116 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229		A8MUU9	505 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	UBL5	Q9BZL1	73 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00846	Q9NV44	126 aa		13.28	□□□□□ -0.28
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		13.27	□□□□□ -0.29
GPS1-223	ENST00000584229	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		13.24	□□□□□ -0.29
GPS1-223	ENST00000584229	PRR15	Q8IV56	129 aa		13.23	□□□□□ -0.29
GPS1-223	ENST00000584229		K7EQZ3	153 aa		13.21	□□□□□ -0.29
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N9L7	120 aa		13.15	□□□□□ -0.3
GPS1-223	ENST00000584229	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		13.12	□□□□□ -0.31
GPS1-223	ENST00000584229	hDV103S1	A0JD37	113 aa		13.07	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	ACYP1	P07311	99 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		13.06	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		13.05	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	NDUFS5	O43920	106 aa		13.03	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	13.03	□□□□□ -0.32
GPS1-223	ENST00000584229	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		13.01	□□□□□ -0.33
GPS1-223	ENST00000584229	CASC2	Q6XLA1	102 aa		13	□□□□□ -0.33
GPS1-223	ENST00000584229	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
GPS1-223	ENST00000584229	CXCL6	P80162	114 aa		12.98	□□□□□ -0.33
GPS1-223	ENST00000584229	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		12.95	□□□□□ -0.34
GPS1-223	ENST00000584229	HCG22	E2RYF7	251 aa		12.93	□□□□□ -0.34
GPS1-223	ENST00000584229	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		12.92	□□□□□ -0.34
GPS1-223	ENST00000584229		J3QR89	54 aa		12.87	□□□□□ -0.35
GPS1-223	ENST00000584229	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	LCE2C	Q5TA81	110 aa		12.79	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	SPINK7	P58062	85 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00643	Q86TS7	51 aa		12.78	□□□□□ -0.36
GPS1-223	ENST00000584229	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GPS1-223	ENST00000584229	FAM236C	P0DP71	79 aa		12.74	□□□□□ -0.37
GPS1-223	ENST00000584229	RBM12B-AS1	Q9P1G2	102 aa		12.72	□□□□□ -0.37
GPS1-223	ENST00000584229	HRES1	P13985	223 aa		12.71	□□□□□ -0.37
GPS1-223	ENST00000584229		Q5W150	140 aa		12.7	□□□□□ -0.38
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GPS1-223	ENST00000584229	IGKV2-30	P06310	120 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GPS1-223	ENST00000584229	MT1H	P80294	61 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GPS1-223	ENST00000584229		A0A087WVE0	104 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229		M0R2T5	61 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		12.61	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229		K7ERU9	68 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		12.59	□□□□□ -0.39
GPS1-223	ENST00000584229	FLG	P20930	4061 aa	Predicted RBP	12.51	□□□□□ -0.41
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GPS1-223	ENST00000584229	UQCRQ	O14949	82 aa		12.4	□□□□□ -0.42
GPS1-223	ENST00000584229	MT-ATP8	P03928	68 aa		12.37	□□□□□ -0.43
GPS1-223	ENST00000584229		H0Y9P7	68 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GPS1-223	ENST00000584229	C4orf26	Q17RF5	130 aa		12.36	□□□□□ -0.43
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	12.35	□□□□□ -0.43
GPS1-223	ENST00000584229	SCGB1A1	P11684	91 aa		12.33	□□□□□ -0.44
GPS1-223	ENST00000584229	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		12.31	□□□□□ -0.44
GPS1-223	ENST00000584229	ATOX1	O00244	68 aa		12.3	□□□□□ -0.44
GPS1-223	ENST00000584229	LOR	P23490	312 aa	Predicted RBP	12.28	□□□□□ -0.44
GPS1-223	ENST00000584229	IMUP	Q9GZP8	106 aa		12.28	□□□□□ -0.44
GPS1-223	ENST00000584229	OCR1	Q9BZK8	76 aa		12.27	□□□□□ -0.45
GPS1-223	ENST00000584229	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		12.27	□□□□□ -0.45
GPS1-223	ENST00000584229	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		12.26	□□□□□ -0.45
GPS1-223	ENST00000584229	MP68	P56378	58 aa		12.22	□□□□□ -0.45
GPS1-223	ENST00000584229	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		12.2	□□□□□ -0.46
GPS1-223	ENST00000584229	LINC00208	Q96KT6	92 aa		12.2	□□□□□ -0.46
GPS1-223	ENST00000584229	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		12.18	□□□□□ -0.46
GPS1-223	ENST00000584229	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		12.18	□□□□□ -0.46
GPS1-223	ENST00000584229	C5orf47	Q569G3	176 aa		12.14	□□□□□ -0.47
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		12.08	□□□□□ -0.48
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		12.07	□□□□□ -0.48
GPS1-223	ENST00000584229		H3BPC8	53 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GPS1-223	ENST00000584229	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GPS1-223	ENST00000584229		S4R3F8	94 aa		12.03	□□□□□ -0.48
GPS1-223	ENST00000584229	KLKP1	Q107X0	134 aa		12.02	□□□□□ -0.49
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		12.01	□□□□□ -0.49
GPS1-223	ENST00000584229	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		11.99	□□□□□ -0.49
GPS1-223	ENST00000584229	MT2A	P02795	61 aa		11.95	□□□□□ -0.5
GPS1-223	ENST00000584229	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	11.95	□□□□□ -0.5
GPS1-223	ENST00000584229	LCA10	Q71F78	164 aa		11.91	□□□□□ -0.5
GPS1-223	ENST00000584229	KRTAP10-10	P60014	251 aa		11.89	□□□□□ -0.51
GPS1-223	ENST00000584229	MT1F	P04733	61 aa		11.86	□□□□□ -0.51
GPS1-223	ENST00000584229		A8MUN3	132 aa		11.83	□□□□□ -0.52
GPS1-223	ENST00000584229	CSAG1	Q6PB30	78 aa		11.82	□□□□□ -0.52
GPS1-223	ENST00000584229	SERP2	Q8N6R1	65 aa		11.78	□□□□□ -0.52
GPS1-223	ENST00000584229	SNURF	Q9Y675	71 aa		11.76	□□□□□ -0.53

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