RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552915.5

CNOT2-241, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, humanhuman

TSL 5

Gene CNOT2, Length 1,071 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT2-241ENST00000552915 LIMD2Q9BT23 127 aa7□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 K7ERU9 68 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 SPINK1P00995 79 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 MT1HL1P0DM35 61 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.99□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00846Q9NV44 126 aa6.98□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 NREPQ16612 68 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 UBL5Q9BZL1 73 aa6.97□□□□□ -1.29
CNOT2-241ENST00000552915 ACYP1P07311 99 aa6.96□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 A0A1B0GW54 56 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 Q6ZVQ6 151 aa6.95□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.94□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 SIGMAR1Q99720 223 aa6.93□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 TNXBP22105 4242 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 MYCBP2O75592 4640 aa6.91□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV2-30P06310 120 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV4-1P06312 121 aa6.9□□□□□ -1.3
CNOT2-241ENST00000552915 BPY2O14599 106 aa6.89□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 C1orf195Q5TG92 126 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 Q5XG85 94 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 Q96NJ1 140 aa6.88□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.87□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.86□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 J3KT08 172 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 PRR4Q16378 134 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00643Q86TS7 51 aa6.84□□□□□ -1.31
CNOT2-241ENST00000552915 Q8N9L7 120 aa6.83□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.83□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.82□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 K7EQZ3 153 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 NDUFB1O75438 58 aa6.81□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 A8MWP4 228 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 DSCR10P59022 87 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 CXCL6P80162 114 aa6.8□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 A0A1B0GVX0 72 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 MT-ATP8P03928 68 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 PCP4P48539 62 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.78□□□□□ -1.32
CNOT2-241ENST00000552915 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 C9orf92A6NGG3 77 aa6.77□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 PRR15Q8IV56 129 aa6.75□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 A0A087WVE0 104 aa6.74□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.73□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 C8orf87E5RJ46 101 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00313P59037 77 aa6.72□□□□□ -1.33
CNOT2-241ENST00000552915 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.71□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 A0A0A0MQY5 61 aa6.7□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 HCG22E2RYF7 251 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 CASC2Q6XLA1 102 aa6.69□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.68□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 hDV103S1A0JD37 113 aa6.67□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 NDUFS5O43920 106 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.66□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.65□□□□□ -1.34
CNOT2-241ENST00000552915 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.64□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 IMUPQ9GZP8 106 aa6.64□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.63□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.63□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 TPRXLQ17RH7 258 aa6.63□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.62□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 SCGB1A1P11684 91 aa6.61□□□□□ -1.35
CNOT2-241ENST00000552915 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.57□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 A8MUU9 505 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 LPAP08519 4548 aa6.54□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 RNF213Q63HN8 5207 aa6.53□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 Q75L30 129 aa6.53□□□□□ -1.36
CNOT2-241ENST00000552915 ATOX1O00244 68 aa6.52□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.51□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.49□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 PCOTHQ58A44 107 aa6.48□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 UQCRQO14949 82 aa6.47□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 OCR1Q9BZK8 76 aa6.47□□□□□ -1.37
CNOT2-241ENST00000552915 H0Y9P7 68 aa6.46□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.46□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 Q5W150 140 aa6.45□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.44□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.43□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 MP68P56378 58 aa6.42□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 SERP2Q8N6R1 65 aa6.41□□□□□ -1.38
CNOT2-241ENST00000552915 LINC00208Q96KT6 92 aa6.39□□□□□ -1.39
CNOT2-241ENST00000552915 LRP2P98164 4655 aa6.39□□□□□ -1.39
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