RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550734.5

CS-221, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 5

Gene CS, Length 747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-221ENST00000550734 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 CCKP06307 115 aa5.94□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 C9JAW5 83 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.93□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 K7EP34 96 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 IGKV4-1P06312 121 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 LINC00313P59037 77 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 SIGMAR1Q99720 223 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 DSCR10P59022 87 aa5.91□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 MTURNQ8N3F0 131 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GV72 72 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 DSCR8Q96T75 97 aa5.89□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 H3BT86 120 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GV90 55 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GW54 56 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 A0A1B0GVX0 72 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 C8orf87E5RJ46 101 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 J3KT08 172 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 Q6ZQT0 140 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 VPS25Q9BRG1 176 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-221ENST00000550734 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 PDE6GP18545 87 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 F8W1H4 67 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 PRO0461Q9UI25 63 aa5.81□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 LCE2BO14633 110 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 MT2AP02795 61 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 HRES1P13985 223 aa5.78□□□□□ -1.48
CS-221ENST00000550734 NDUFB1O75438 58 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 A8MWP4 228 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 ETDBQ3ZM63 59 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 MT1FP04733 61 aa5.74□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.72□□□□□ -1.49
CS-221ENST00000550734 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 FAM236CP0DP71 79 aa5.71□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 SPINK7P58062 85 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 PRR15Q8IV56 129 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 NREPQ16612 68 aa5.69□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 Q6ZVQ6 151 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 KRTAP10-10P60014 251 aa5.67□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.66□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 LINC00846Q9NV44 126 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-221ENST00000550734 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.64□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 UBL5Q9BZL1 73 aa5.62□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 J3QR89 54 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.61□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 hDV103S1A0JD37 113 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 K7EQZ3 153 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 ACYP1P07311 99 aa5.6□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 BPY2O14599 106 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-221ENST00000550734 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-221ENST00000550734 NEBP20929 6669 aa5.55□□□□□ -1.52
CS-221ENST00000550734 K7ERU9 68 aa5.54□□□□□ -1.52
CS-221ENST00000550734 NDUFS5O43920 106 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 Q5W150 140 aa5.52□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 CASC2Q6XLA1 102 aa5.51□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 CXCL6P80162 114 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 Q8N9L7 120 aa5.49□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 LINC00643Q86TS7 51 aa5.48□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 IGKV2-30P06310 120 aa5.47□□□□□ -1.53
CS-221ENST00000550734 HCG22E2RYF7 251 aa5.46□□□□□ -1.54
CS-221ENST00000550734 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.45□□□□□ -1.54
CS-221ENST00000550734 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
CS-221ENST00000550734 C4orf26Q17RF5 130 aa5.39□□□□□ -1.55
CS-221ENST00000550734 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.38□□□□□ -1.55
CS-221ENST00000550734 A0A087WVE0 104 aa5.37□□□□□ -1.55
CS-221ENST00000550734 MT-ATP8P03928 68 aa5.36□□□□□ -1.55
CS-221ENST00000550734 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.35□□□□□ -1.55
CS-221ENST00000550734 IMUPQ9GZP8 106 aa5.33□□□□□ -1.56
CS-221ENST00000550734 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.32□□□□□ -1.56
CS-221ENST00000550734 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.3□□□□□ -1.56
CS-221ENST00000550734 SCGB1A1P11684 91 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-221ENST00000550734 S4R3F8 94 aa5.28□□□□□ -1.56
CS-221ENST00000550734 C5orf47Q569G3 176 aa5.27□□□□□ -1.57
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