RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 IGKV4-1P06312 121 aa4.47□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 MOBPQ13875 183 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 Q6ZQY7 126 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 COX7BP24311 80 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 TNXBP22105 4242 aa4.45□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 C9orf92A6NGG3 77 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 C4orf48Q5BLP8 95 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 M0R378 163 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 VPREB1P12018 145 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-8P60410 259 aa4.44□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 IGLV6-57P01721 117 aa4.43□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.42□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.42□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.41□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 Q8NBF4 154 aa4.4□□□□□ -1.7
CS-212ENST00000548567 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 Q8N9L7 120 aa4.4□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 PSPHP1O15172 72 aa4.39□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.38□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 A0A1B0GW54 56 aa4.38□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 SMIM29Q86T20 159 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.37□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 NDUFS5O43920 106 aa4.37□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 A8MUN3 132 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 Q5VV11 94 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 NDUFB1O75438 58 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 Q9BRP9 147 aa4.36□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 LIMD2Q9BT23 127 aa4.35□□□□□ -1.71
CS-212ENST00000548567 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.33□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 SPRR4Q96PI1 79 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.32□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 A6NN06 94 aa4.31□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.31□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 A8MU10 97 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 Q75L30 129 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.3□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 HCG22E2RYF7 251 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 H3BPC8 53 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 DSCR10P59022 87 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 LINC00208Q96KT6 92 aa4.29□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 A0A1W2PNM2 257 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 MP68P56378 58 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 PRR15LQ9BU68 103 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 Q6ZRX8 168 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.28□□□□□ -1.72
CS-212ENST00000548567 Q8N377 158 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 LCA10Q71F78 164 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.27□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 K7EQZ3 153 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 USH2AO75445 5202 aa4.26□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 A6NED7 52 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 PCOTHQ58A44 107 aa4.25□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 M0R2T5 61 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa4.24□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 C8orf87E5RJ46 101 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 H0Y9P7 68 aa4.22□□□□□ -1.73
CS-212ENST00000548567 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 COA5Q86WW8 74 aa4.21□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.19□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 SPRR1AP35321 89 aa4.18□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 SPINK1P00995 79 aa4.17□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 CASC2Q6XLA1 102 aa4.16□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 A0A087WSZ3 146 aa4.15□□□□□ -1.74
CS-212ENST00000548567 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.14□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 XP32Q5T750 250 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 IGFL1Q6UW32 110 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 Q96NJ1 140 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 SPINK7P58062 85 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.13□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 A8MWP4 228 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 LINC00313P59037 77 aa4.12□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 H3BS24 57 aa4.11□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 LINC01554Q52M75 96 aa4.1□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 TPRXLQ17RH7 258 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-212ENST00000548567 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.09□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 95.1 ms