RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 MT2AP02795 61 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.9□□□□□ -1.46
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BQ85 93 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EP34 96 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 UBE2V1Q13404 147 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 ATXN8Q156A1 80 aa5.89□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GV90 55 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAL4O96015 105 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 CCKP06307 115 aa5.88□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 TRACP01848 142 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.87□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1FP04733 61 aa5.86□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 LCE2BO14633 110 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.85□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GVX0 72 aa5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 C9JAW5 83 aa5.81□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
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CLSTN3-211ENST00000541667 C8orf87E5RJ46 101 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 H3BT86 120 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM236CP0DP71 79 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.8□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZQT0 140 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 MTURNQ8N3F0 131 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 VPS25Q9BRG1 176 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 PRO0461Q9UI25 63 aa5.79□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 DSCR8Q96T75 97 aa5.78□□□□□ -1.48
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 F8W1H4 67 aa5.76□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 SPINK7P58062 85 aa5.76□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP10-10P60014 251 aa5.76□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.76□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 J3KT08 172 aa5.75□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
CLSTN3-211ENST00000541667 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.71□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.71□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.71□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.71□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 A8MWP4 228 aa5.7□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A1B0GW54 56 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 ETDBQ3ZM63 59 aa5.69□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFB1O75438 58 aa5.68□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 Q6ZVQ6 151 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 PRR15Q8IV56 129 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.65□□□□□ -1.5
CLSTN3-211ENST00000541667 PDE6GP18545 87 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.64□□□□□ -1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.63□□□□□ -1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.62□□□□□ -1.51
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CLSTN3-211ENST00000541667 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
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CLSTN3-211ENST00000541667 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.59□□□□□ -1.51
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.58□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 Q5W150 140 aa5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.57□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 K7EQZ3 153 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.56□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 hDV103S1A0JD37 113 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 K7ERU9 68 aa5.55□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 ACYP1P07311 99 aa5.54□□□□□ -1.52
CLSTN3-211ENST00000541667 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00846Q9NV44 126 aa5.5□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 NDUFS5O43920 106 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 UBL5Q9BZL1 73 aa5.49□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 BPY2O14599 106 aa5.48□□□□□ -1.53
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CLSTN3-211ENST00000541667 IGKV2-30P06310 120 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 Q8N9L7 120 aa5.47□□□□□ -1.53
CLSTN3-211ENST00000541667 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.45□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 HCG22E2RYF7 251 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 C4orf26Q17RF5 130 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 CASC2Q6XLA1 102 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 LINC00643Q86TS7 51 aa5.43□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.42□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 CXCL6P80162 114 aa5.41□□□□□ -1.54
CLSTN3-211ENST00000541667 MT1BP07438 61 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-211ENST00000541667 C5orf47Q569G3 176 aa5.36□□□□□ -1.55
CLSTN3-211ENST00000541667 MT-ATP8P03928 68 aa5.35□□□□□ -1.55
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CLSTN3-211ENST00000541667 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 IMUPQ9GZP8 106 aa5.32□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 LCA10Q71F78 164 aa5.31□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 S4R3F8 94 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 A0A087WVE0 104 aa5.28□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 CSAG1Q6PB30 78 aa5.28□□□□□ -1.56
CLSTN3-211ENST00000541667 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.27□□□□□ -1.57
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