RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496526.5

TTLL3-232, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, humanhuman

TSL 2

Gene TTLL3, Length 5,282 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL3-232ENST00000496526 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.11□□□□□ -1.43
TTLL3-232ENST00000496526 COL12A1Q99715 3063 aa6.09□□□□□ -1.43
TTLL3-232ENST00000496526 APCP25054 2843 aa6.08□□□□□ -1.44
TTLL3-232ENST00000496526 A0A0A0MQY5 61 aa6.07□□□□□ -1.44
TTLL3-232ENST00000496526 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.06□□□□□ -1.44
TTLL3-232ENST00000496526 FRYLO94915 3013 aa6.05□□□□□ -1.44
TTLL3-232ENST00000496526 COL6A3P12111 3177 aa6.02□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 USP34Q70CQ2 3546 aa6.02□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 LRBAP50851 2863 aa6□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.99□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.99□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 NBEAQ8NFP9 2946 aa5.98□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 KALRNO60229 2985 aa5.97□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
TTLL3-232ENST00000496526 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.95□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa5.95□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 XP32Q5T750 250 aa5.95□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 A8MU10 97 aa5.94□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 TPRXLQ17RH7 258 aa5.93□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.93□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 ZZEF1O43149 2961 aa5.92□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.92□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 TNP1P09430 55 aa5.9□□□□□ -1.46
TTLL3-232ENST00000496526 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.9□□□□□ -1.47
TTLL3-232ENST00000496526 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
TTLL3-232ENST00000496526 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.86□□□□□ -1.47
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.86□□□□□ -1.47
TTLL3-232ENST00000496526 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.84□□□□□ -1.47
TTLL3-232ENST00000496526 A6NN06 94 aa5.83□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 ZANQ9Y493 2812 aa5.83□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.8□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.79□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 H3BS24 57 aa5.78□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 TENM3Q9P273 2699 aa5.78□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.78□□□□□ -1.48
TTLL3-232ENST00000496526 A0A1B0GVY2 172 aa5.76□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 NF1P21359 2839 aa5.76□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.75□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 PP632Q6XCG6 107 aa5.75□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.74□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP10-8P60410 259 aa5.74□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 DMDP11532 3685 aa5.74□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.73□□□□□ -1.49
TTLL3-232ENST00000496526 TENM2Q9NT68 2774 aa5.71□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP10-10P60014 251 aa5.71□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.69□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.68□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.66□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 MUC3AQ02505 3323 aa5.66□□□□□ -1.5
TTLL3-232ENST00000496526 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.64□□□□□ -1.51
TTLL3-232ENST00000496526 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.64□□□□□ -1.51
TTLL3-232ENST00000496526 LAMA5O15230 3695 aa5.62□□□□□ -1.51
TTLL3-232ENST00000496526 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.62□□□□□ -1.51
TTLL3-232ENST00000496526 FBN2P35556 2912 aa5.62□□□□□ -1.51
TTLL3-232ENST00000496526 H0YAA0 97 aa5.58□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 RELNP78509 3460 aa5.57□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.54□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.54□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 NDUFAF8A1L188 74 aa5.54□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 P0C880 135 aa5.53□□□□□ -1.52
TTLL3-232ENST00000496526 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
TTLL3-232ENST00000496526 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.5□□□□□ -1.53
TTLL3-232ENST00000496526 PDZD2O15018 2839 aa5.47□□□□□ -1.53
TTLL3-232ENST00000496526 TGP01266 2768 aa5.46□□□□□ -1.54
TTLL3-232ENST00000496526 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.43□□□□□ -1.54
TTLL3-232ENST00000496526 VWFP04275 2813 aa5.37□□□□□ -1.55
TTLL3-232ENST00000496526 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.34□□□□□ -1.55
TTLL3-232ENST00000496526 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.34□□□□□ -1.55
TTLL3-232ENST00000496526 BSNQ9UPA5 3926 aa5.32□□□□□ -1.56
TTLL3-232ENST00000496526 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.28□□□□□ -1.56
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP12-2P59991 146 aa5.27□□□□□ -1.57
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.24□□□□□ -1.57
TTLL3-232ENST00000496526 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP12-1P59990 96 aa5.22□□□□□ -1.57
TTLL3-232ENST00000496526 MT1HL1P0DM35 61 aa5.22□□□□□ -1.57
TTLL3-232ENST00000496526 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.16□□□□□ -1.58
TTLL3-232ENST00000496526 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TTLL3-232ENST00000496526 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
TTLL3-232ENST00000496526 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.1□□□□□ -1.59
TTLL3-232ENST00000496526 FBN3Q75N90 2809 aa5.1□□□□□ -1.59
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 ZFHX3Q15911 3703 aa5.08□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 CUBNO60494 3623 aa5.07□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.04□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.03□□□□□ -1.6
TTLL3-232ENST00000496526 VPS13CQ709C8 3753 aa5.02□□□□□ -1.61
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.01□□□□□ -1.61
TTLL3-232ENST00000496526 COL7A1Q02388 2944 aa4.95□□□□□ -1.62
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.92□□□□□ -1.62
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP10-12P60413 245 aa4.9□□□□□ -1.62
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.9□□□□□ -1.62
TTLL3-232ENST00000496526 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.9□□□□□ -1.63
TTLL3-232ENST00000496526 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.88□□□□□ -1.63
TTLL3-232ENST00000496526 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
TTLL3-232ENST00000496526 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
TTLL3-232ENST00000496526 AKAP9Q99996 3911 aa4.82□□□□□ -1.64
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.76□□□□□ -1.65
TTLL3-232ENST00000496526 KRTAP12-3P60328 96 aa4.74□□□□□ -1.65
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