RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	PANO1	I0J062	215 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	C22orf24	Q9Y442	160 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	HSPG2	P98160	4391 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2B	P63146	152 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	NREP	Q16612	68 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZQT0	140 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBM39-240	ENST00000495293	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		A0A087WVE0	104 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1W2PNN7	141 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAM19A5	Q7Z5A7	132 aa	Predicted RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		F8WEM9	126 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	BPY2	O14599	106 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFC1	O43677	76 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf137	Q5JT78	98 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAT1	Q14517	4588 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1B0GW54	56 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAM168B	A1KXE4	195 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	C20orf197	Q8N268	126 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		A8MU10	97 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	FAM236C	P0DP71	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV7-43	P04211	117 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	C5orf47	Q569G3	176 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293		Q8NDZ9	215 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	ERC2-IT1	O76042	136 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		2.72	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		2.71	□□□□□ -1.97
RBM39-240	ENST00000495293	UBE2A	P49459	152 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293		Q6ZRX8	168 aa		2.71	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293		H0Y9J4	135 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF861P	O60384	105 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	SNURF	Q9Y675	71 aa		2.7	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	KLKP1	Q107X0	134 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		2.69	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	MP68	P56378	58 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		2.68	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293		H7BZZ5	65 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	NDUFB1	O75438	58 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	IGKV4-1	P06312	121 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		2.67	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	MYCBP2	O75592	4640 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	SPRR1A	P35321	89 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	PRLH	P81277	87 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293		Q8N9L7	120 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293	FAT3	Q8TDW7	4589 aa		2.65	□□□□□ -1.98
RBM39-240	ENST00000495293		A0A1W2PNM2	257 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	HCG22	E2RYF7	251 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	SPRR4	Q96PI1	79 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293		Q9BRP9	147 aa		2.65	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	LRP1	Q07954	4544 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293		A0A0U1RQV1	116 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	MT1HL1	P0DM35	61 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	C4orf26	Q17RF5	130 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		2.64	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293		A0A087WSZ3	146 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293		H3BPC8	53 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	CD164	Q04900	197 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	HERC1	Q15751	4861 aa		2.63	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	IGFL1	Q6UW32	110 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		2.62	□□□□□ -1.99
RBM39-240	ENST00000495293	hDV103S1	A0JD37	113 aa		2.61	□□□□□ -1.99

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