RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469972.5

RALGDS-208, Transcript of ral guanine nucleotide dissociation stimulator, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RALGDS, Length 5,817 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGDS-208ENST00000469972 PP632Q6XCG6 107 aa7.35□□□□□ -1.23
RALGDS-208ENST00000469972 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RALGDS-208ENST00000469972 TACC2O95359 2948 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 ATMQ13315 3056 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 FREM2Q5SZK8 3169 aa7.31□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 APCP25054 2843 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 LRBAP50851 2863 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 HIVEP1P15822 2718 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 FLNCQ14315 2725 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGDS-208ENST00000469972 COL12A1Q99715 3063 aa7.26□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 SZT2Q5T011 3432 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 LAMA1P25391 3075 aa7.23□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 NDUFAF8A1L188 74 aa7.23□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 COL6A3P12111 3177 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.22□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 FRYLO94915 3013 aa7.21□□□□□ -1.25
RALGDS-208ENST00000469972 VCANP13611 3396 aa7.18□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa7.17□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa7.17□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 REV3LO60673 3130 aa7.16□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 TENM4Q6N022 2769 aa7.15□□□□□ -1.26
RALGDS-208ENST00000469972 H0YAA0 97 aa7.14□□□□□ -1.27
RALGDS-208ENST00000469972 EYSQ5T1H1 3165 aa7.12□□□□□ -1.27
RALGDS-208ENST00000469972 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.1□□□□□ -1.27
RALGDS-208ENST00000469972 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
RALGDS-208ENST00000469972 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.09□□□□□ -1.28
RALGDS-208ENST00000469972 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa7.08□□□□□ -1.28
RALGDS-208ENST00000469972 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGDS-208ENST00000469972 P0C880 135 aa7.05□□□□□ -1.28
RALGDS-208ENST00000469972 ZZEF1O43149 2961 aa7.05□□□□□ -1.28
RALGDS-208ENST00000469972 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.99□□□□□ -1.29
RALGDS-208ENST00000469972 USP34Q70CQ2 3546 aa6.94□□□□□ -1.3
RALGDS-208ENST00000469972 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
RALGDS-208ENST00000469972 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
RALGDS-208ENST00000469972 ZANQ9Y493 2812 aa6.92□□□□□ -1.3
RALGDS-208ENST00000469972 SPEGQ15772 3267 aa6.9□□□□□ -1.31
RALGDS-208ENST00000469972 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.85□□□□□ -1.31
RALGDS-208ENST00000469972 TENM2Q9NT68 2774 aa6.83□□□□□ -1.32
RALGDS-208ENST00000469972 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.82□□□□□ -1.32
RALGDS-208ENST00000469972 NF1P21359 2839 aa6.81□□□□□ -1.32
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP12-2P59991 146 aa6.79□□□□□ -1.32
RALGDS-208ENST00000469972 FBN2P35556 2912 aa6.78□□□□□ -1.32
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.77□□□□□ -1.33
RALGDS-208ENST00000469972 TENM3Q9P273 2699 aa6.71□□□□□ -1.34
RALGDS-208ENST00000469972 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.7□□□□□ -1.34
RALGDS-208ENST00000469972 TGP01266 2768 aa6.68□□□□□ -1.34
RALGDS-208ENST00000469972 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP12-1P59990 96 aa6.66□□□□□ -1.34
RALGDS-208ENST00000469972 MYO15AQ9UKN7 3530 aa6.65□□□□□ -1.35
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.65□□□□□ -1.35
RALGDS-208ENST00000469972 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RALGDS-208ENST00000469972 MT1HL1P0DM35 61 aa6.59□□□□□ -1.36
RALGDS-208ENST00000469972 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.59□□□□□ -1.36
RALGDS-208ENST00000469972 PDZD2O15018 2839 aa6.58□□□□□ -1.36
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.54□□□□□ -1.36
RALGDS-208ENST00000469972 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.52□□□□□ -1.37
RALGDS-208ENST00000469972 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.51□□□□□ -1.37
RALGDS-208ENST00000469972 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGDS-208ENST00000469972 RELNP78509 3460 aa6.46□□□□□ -1.38
RALGDS-208ENST00000469972 VWFP04275 2813 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGDS-208ENST00000469972 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.44□□□□□ -1.38
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGDS-208ENST00000469972 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
RALGDS-208ENST00000469972 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGDS-208ENST00000469972 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.34□□□□□ -1.39
RALGDS-208ENST00000469972 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP10-12P60413 245 aa6.31□□□□□ -1.4
RALGDS-208ENST00000469972 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.29□□□□□ -1.4
RALGDS-208ENST00000469972 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.23□□□□□ -1.41
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.23□□□□□ -1.41
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.21□□□□□ -1.42
RALGDS-208ENST00000469972 LAMA5O15230 3695 aa6.19□□□□□ -1.42
RALGDS-208ENST00000469972 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RALGDS-208ENST00000469972 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
RALGDS-208ENST00000469972 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.15□□□□□ -1.43
RALGDS-208ENST00000469972 DMDP11532 3685 aa6.15□□□□□ -1.43
RALGDS-208ENST00000469972 FBN3Q75N90 2809 aa6.13□□□□□ -1.43
RALGDS-208ENST00000469972 ZFHX3Q15911 3703 aa6.1□□□□□ -1.43
RALGDS-208ENST00000469972 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.07□□□□□ -1.44
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP12-3P60328 96 aa6.06□□□□□ -1.44
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.04□□□□□ -1.44
RALGDS-208ENST00000469972 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RALGDS-208ENST00000469972 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6□□□□□ -1.45
RALGDS-208ENST00000469972 LCE3AQ5TA76 89 aa5.99□□□□□ -1.45
RALGDS-208ENST00000469972 INE1O15225 51 aa5.98□□□□□ -1.45
RALGDS-208ENST00000469972 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.94□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.94□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.94□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.94□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 COL7A1Q02388 2944 aa5.93□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.93□□□□□ -1.46
RALGDS-208ENST00000469972 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.3 ms