RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 IGKV2-30P06310 120 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 A8MU10 97 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 Q5VV11 94 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GU69 56 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.62□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 ACYP2P14621 99 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR1AP35321 89 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 BIRC6Q9NR09 4857 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.6□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH3Q8TD57 4116 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.59□□□□□ -1.83
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GVX0 72 aa3.59□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 RYR2Q92736 4967 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.58□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.57□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.57□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 SPINK7P58062 85 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 PRAC1Q96KF2 57 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 RYR3Q15413 4870 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 Q75L30 129 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.56□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00313P59037 77 aa3.55□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.55□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 C8orf87E5RJ46 101 aa3.55□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 LCA10Q71F78 164 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 HRES1P13985 223 aa3.54□□□□□ -1.84
SHQ1-205ENST00000468371 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.53□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.53□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 CSMD3Q7Z407 3707 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 UQCR11O14957 56 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 COX6B2Q6YFQ2 88 aa3.52□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 K7ERS5 55 aa3.51□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 VPS13DQ5THJ4 4388 aa3.51□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 Q96NJ1 140 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 A0A087X002 238 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.49□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 LYSTQ99698 3801 aa3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 C9orf92A6NGG3 77 aa3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 SPRR1BP22528 89 aa3.48□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-8P60410 259 aa3.47□□□□□ -1.85
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH7Q8WXX0 4024 aa3.46□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 KMT2AQ03164 3969 aa3.45□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 Q5W150 140 aa3.45□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.45□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 A6NN06 94 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 M0R2T5 61 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 LINC01554Q52M75 96 aa3.44□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 HERC2O95714 4834 aa3.43□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 RYR1P21817 5038 aa3.43□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 CSAG1Q6PB30 78 aa3.43□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.42□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.42□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.42□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 MT1HL1P0DM35 61 aa3.41□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 H3BS24 57 aa3.41□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.41□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 CRIPTQ9P021 101 aa3.41□□□□□ -1.86
SHQ1-205ENST00000468371 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.4□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 LINC00483Q53H64 154 aa3.39□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 FAT1Q14517 4588 aa3.38□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 DMAC1Q96GE9 116 aa3.37□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 A0A0D9SG42 100 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 RPS29P62273 56 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 TPRXLQ17RH7 258 aa3.36□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.35□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 A0A1B0GU33 70 aa3.34□□□□□ -1.87
SHQ1-205ENST00000468371 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.33□□□□□ -1.88
SHQ1-205ENST00000468371 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms