RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467464.1

PTPRF-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf87E5RJ46 101 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 RBM3P98179 157 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 MT1FP04733 61 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 VPS25Q9BRG1 176 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 SCGB1C2P0DMR2 95 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 FAM236CP0DP71 79 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZQT0 140 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 DSCR8Q96T75 97 aa5.91□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRF-211ENST00000467464 LCE2BO14633 110 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 C9JAW5 83 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 J3KT08 172 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 M0R143 59 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 BATFQ16520 125 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 SPINK7P58062 85 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.84□□□□□ -1.47
PTPRF-211ENST00000467464 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 A8MWP4 228 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP10-10P60014 251 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 ATXN8Q156A1 80 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1B0GW54 56 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFB1O75438 58 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 C14orf132Q9NPU4 83 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 PDE6GP18545 87 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 MTURNQ8N3F0 131 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRF-211ENST00000467464 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 Q6ZVQ6 151 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 PRR15Q8IV56 129 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1B0GV90 55 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 TAX1BP3O14907 124 aa5.76□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 TMEM254Q8TBM7 123 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 NREPQ16612 68 aa5.72□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PTPRF-211ENST00000467464 C9orf118A6NHY6 69 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 K7EQZ3 153 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.71□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 hDV103S1A0JD37 113 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 H3BT86 120 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 A0A1W2PPM0 123 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 Q5W150 140 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRF-211ENST00000467464 SPCS1Q9Y6A9 102 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 K7EP34 96 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 NDUFS5O43920 106 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 BPY2O14599 106 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 Q8N9L7 120 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 IGKV2-30P06310 120 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRF-211ENST00000467464 CASC2Q6XLA1 102 aa5.57□□□□□ -1.52
PTPRF-211ENST00000467464 HCG22E2RYF7 251 aa5.55□□□□□ -1.52
PTPRF-211ENST00000467464 C4orf26Q17RF5 130 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-211ENST00000467464 LINC00846Q9NV44 126 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-211ENST00000467464 PRO0461Q9UI25 63 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.52□□□□□ -1.53
PTPRF-211ENST00000467464 F8W1H4 67 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRF-211ENST00000467464 CXCL6P80162 114 aa5.51□□□□□ -1.53
PTPRF-211ENST00000467464 ETDBQ3ZM63 59 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 C5orf47Q569G3 176 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 UBL5Q9BZL1 73 aa5.46□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.45□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.45□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 MT1BP07438 61 aa5.44□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 LCA10Q71F78 164 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 S4R3F8 94 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRF-211ENST00000467464 K7ERU9 68 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.38□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 CSAG1Q6PB30 78 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.37□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 J3QR89 54 aa5.36□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 Q5VV11 94 aa5.34□□□□□ -1.55
PTPRF-211ENST00000467464 A0A087WVE0 104 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRF-211ENST00000467464 A6NN06 94 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRF-211ENST00000467464 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.32□□□□□ -1.56
PTPRF-211ENST00000467464 KLKP1Q107X0 134 aa5.31□□□□□ -1.56
PTPRF-211ENST00000467464 KRTAP10-5P60370 271 aa5.3□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.9 ms