RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462125.5

C9orf3-210, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-210ENST00000462125 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.3□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 Q5XG85 94 aa7.29□□□□□ -1.24
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.27□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 Q6ZVQ6 151 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 A0A0G2JQZ4 141 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 CXCL6P80162 114 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf195Q5TG92 126 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 NREPQ16612 68 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1W2PNM2 257 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.18□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 C9orf92A6NGG3 77 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 IGFL1Q6UW32 110 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 ATOX1O00244 68 aa7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
C9orf3-210ENST00000462125 BPY2O14599 106 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-210ENST00000462125 PCOTHQ58A44 107 aa7.14□□□□□ -1.27
C9orf3-210ENST00000462125 LCE2CQ5TA81 110 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-210ENST00000462125 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-210ENST00000462125 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WSZ3 146 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 A0A087WVE0 104 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 J3KT08 172 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 UQCRQO14949 82 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 IGKV4-1P06312 121 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 SERP2Q8N6R1 65 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-210ENST00000462125 COX7CP15954 63 aa7.02□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 DSCR10P59022 87 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 MT1HP80294 61 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 Q75L30 129 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-210ENST00000462125 A8MWP4 228 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFB1O75438 58 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 K7EQZ3 153 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N9L7 120 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 HCG22E2RYF7 251 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 CCDC179H3BU77 68 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 Q96NJ1 140 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 PRR15Q8IV56 129 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.91□□□□□ -1.3
C9orf3-210ENST00000462125 A8MUU9 505 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.88□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 OCR1Q9BZK8 76 aa6.87□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 CASC2Q6XLA1 102 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.86□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 A0A1B0GVX0 72 aa6.84□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFC1O43677 76 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 KLKP1Q107X0 134 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 C20orf197Q8N268 126 aa6.83□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 C8orf87E5RJ46 101 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00313P59037 77 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 C5orf47Q569G3 176 aa6.82□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 hDV103S1A0JD37 113 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 M0R2T5 61 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.81□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM258P61165 79 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.8□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 H3BPC8 53 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.79□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 MP68P56378 58 aa6.78□□□□□ -1.32
C9orf3-210ENST00000462125 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.77□□□□□ -1.33
C9orf3-210ENST00000462125 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
C9orf3-210ENST00000462125 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
C9orf3-210ENST00000462125 SNURFQ9Y675 71 aa6.72□□□□□ -1.33
C9orf3-210ENST00000462125 H7BZZ5 65 aa6.71□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.7□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 H0Y9P7 68 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 FAM236CP0DP71 79 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.69□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 NDUFS5O43920 106 aa6.68□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.67□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 HRES1P13985 223 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.65□□□□□ -1.34
C9orf3-210ENST00000462125 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 LINC00208Q96KT6 92 aa6.64□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 SSPOA2VEC9 5147 aa6.63□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.62□□□□□ -1.35
C9orf3-210ENST00000462125 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.4 ms