RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444040.6

SHQ1-202, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2

Gene SHQ1, Length 2,844 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-202ENST00000444040 CDK2AP2O75956 126 aa9.43□□□□□ -0.9
SHQ1-202ENST00000444040 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.41□□□□□ -0.9
SHQ1-202ENST00000444040 PRO0628Q9UI54 55 aa9.4□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 CD164Q04900 197 aa9.39□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 NDUFS5O43920 106 aa9.38□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.38□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.37□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.36□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 Q6ZSA8 131 aa9.36□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 PCOTHQ58A44 107 aa9.34□□□□□ -0.91
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-1P60331 282 aa9.33□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 BRK1Q8WUW1 75 aa9.32□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 PKD1P98161 4303 aa9.32□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.32□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.31□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 FAT2Q9NYQ8 4349 aa9.3□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa9.3□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 PSPHP1O15172 72 aa9.28□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa9.27□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 COA5Q86WW8 74 aa9.27□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 V9GYY9 64 aa9.27□□□□□ -0.92
SHQ1-202ENST00000444040 Q5W150 140 aa9.27□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 C8orf87E5RJ46 101 aa9.25□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 A8MUN3 132 aa9.23□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 C1orf195Q5TG92 126 aa9.23□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa9.23□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.22□□□□□ -0.93
SHQ1-202ENST00000444040 Q5VV11 94 aa9.19□□□□□ -0.94
SHQ1-202ENST00000444040 LIMD2Q9BT23 127 aa9.19□□□□□ -0.94
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00313P59037 77 aa9.18□□□□□ -0.94
SHQ1-202ENST00000444040 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.16□□□□□ -0.94
SHQ1-202ENST00000444040 HRES1P13985 223 aa9.16□□□□□ -0.94
SHQ1-202ENST00000444040 PRR15LQ9BU68 103 aa9.12□□□□□ -0.95
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa9.12□□□□□ -0.95
SHQ1-202ENST00000444040 FAM229AH3BQW9 127 aa9.1□□□□□ -0.95
SHQ1-202ENST00000444040 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa9.09□□□□□ -0.95
SHQ1-202ENST00000444040 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.07□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 SPAG11AQ6PDA7 123 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 Q75L30 129 aa9.06□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.05□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.05□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV2-30P06310 120 aa9.04□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 A8MU10 97 aa9.04□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 SPINK1P00995 79 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.03□□□□□ -0.96
SHQ1-202ENST00000444040 PKHD1P08F94 4074 aa9.02□□□□□ -0.97
SHQ1-202ENST00000444040 ACYP2P14621 99 aa9.01□□□□□ -0.97
SHQ1-202ENST00000444040 DMAC1Q96GE9 116 aa9.01□□□□□ -0.97
SHQ1-202ENST00000444040 PRR26Q8N8Z3 221 aa9□□□□□ -0.97
SHQ1-202ENST00000444040 LCA10Q71F78 164 aa8.95□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 A6NED7 52 aa8.94□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.93□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.91□□□□□ -0.98
SHQ1-202ENST00000444040 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.9□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GVY2 172 aa8.89□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.87□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 SPINK7P58062 85 aa8.86□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
SHQ1-202ENST00000444040 FAT1Q14517 4588 aa8.83□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.83□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 PMAIP1Q13794 54 aa8.81□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.81□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.8□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.78□□□□□ -1
SHQ1-202ENST00000444040 RYR2Q92736 4967 aa8.75□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.73□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 A0A1B0GU69 56 aa8.72□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 A8MUU9 505 aa8.72□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 C9orf92A6NGG3 77 aa8.72□□□□□ -1.01
SHQ1-202ENST00000444040 A6NN06 94 aa8.7□□□□□ -1.02
SHQ1-202ENST00000444040 Q8N1X5 172 aa8.68□□□□□ -1.02
SHQ1-202ENST00000444040 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
SHQ1-202ENST00000444040 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.62□□□□□ -1.03
SHQ1-202ENST00000444040 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.6□□□□□ -1.03
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa8.57□□□□□ -1.04
SHQ1-202ENST00000444040 UQCR11O14957 56 aa8.56□□□□□ -1.04
SHQ1-202ENST00000444040 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SHQ1-202ENST00000444040 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.53□□□□□ -1.04
SHQ1-202ENST00000444040 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.52□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 TNXBP22105 4242 aa8.51□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP10-8P60410 259 aa8.5□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 HSPG2P98160 4391 aa8.46□□□□□ -1.05
SHQ1-202ENST00000444040 SEC61GP60059 68 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-202ENST00000444040 Q5VSD8 79 aa8.45□□□□□ -1.06
SHQ1-202ENST00000444040 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.41□□□□□ -1.06
SHQ1-202ENST00000444040 RYR1P21817 5038 aa8.38□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RYR3Q15413 4870 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.37□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.36□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
SHQ1-202ENST00000444040 H0YAA0 97 aa8.32□□□□□ -1.08
SHQ1-202ENST00000444040 XP32Q5T750 250 aa8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.9 ms