RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420058.1

NFE4-201, Transcript of nuclear factor, erythroid 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NFE4, Length 1,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GX51 115 aa6.7□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.7□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.7□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 A0A0B4J2C4 111 aa6.68□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 COX8AP10176 69 aa6.68□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 RAB37Q96AX2 223 aa6.68□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GVX0 72 aa6.67□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.67□□□□□ -1.34
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GV72 72 aa6.66□□□□□ -1.34
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NFE4-201ENST00000420058 H3BQ85 93 aa6.55□□□□□ -1.36
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NFE4-201ENST00000420058 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.54□□□□□ -1.36
NFE4-201ENST00000420058 UBE2V1Q13404 147 aa6.53□□□□□ -1.36
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NFE4-201ENST00000420058 MT1BP07438 61 aa6.52□□□□□ -1.37
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NFE4-201ENST00000420058 J3KT08 172 aa6.51□□□□□ -1.37
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NFE4-201ENST00000420058 KRTAP5-9P26371 169 aa6.49□□□□□ -1.37
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NFE4-201ENST00000420058 K7ERJ3 54 aa6.45□□□□□ -1.38
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NFE4-201ENST00000420058 PSMB2P49721 201 aa6.44□□□□□ -1.38
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NFE4-201ENST00000420058 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
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NFE4-201ENST00000420058 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.34□□□□□ -1.39
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NFE4-201ENST00000420058 IGKV2-30P06310 120 aa6.32□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 A0A1B0GW54 56 aa6.31□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 C5orf47Q569G3 176 aa6.31□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.3□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.29□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 S100A1P23297 94 aa6.29□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 C4orf26Q17RF5 130 aa6.29□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.29□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.28□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.28□□□□□ -1.4
NFE4-201ENST00000420058 hDV103S1A0JD37 113 aa6.28□□□□□ -1.4
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NFE4-201ENST00000420058 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.21□□□□□ -1.42
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NFE4-201ENST00000420058 SPRR2AP35326 72 aa6.14□□□□□ -1.43
NFE4-201ENST00000420058 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.14□□□□□ -1.43
NFE4-201ENST00000420058 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.14□□□□□ -1.43
NFE4-201ENST00000420058 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
NFE4-201ENST00000420058 HCG22E2RYF7 251 aa6.12□□□□□ -1.43
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