RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 C9JAW5 83 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 TAX1BP3O14907 124 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZQT0 140 aa6.34□□□□□ -1.39
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GW54 56 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 C9orf118A6NHY6 69 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 IGKV4-1P06312 121 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 BATFQ16520 125 aa6.33□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 SIGMAR1Q99720 223 aa6.32□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 A0A1W2PPM0 123 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 DSCR10P59022 87 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.31□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 PDE6GP18545 87 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 USH2AO75445 5202 aa6.3□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 SSPOA2VEC9 5147 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 LINC00313P59037 77 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 VPS25Q9BRG1 176 aa6.29□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 H3BT86 120 aa6.28□□□□□ -1.4
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GVX0 72 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 J3KT08 172 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.26□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 C8orf87E5RJ46 101 aa6.25□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 FAM236CP0DP71 79 aa6.24□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.23□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 MT2AP02795 61 aa6.22□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
PRAME-204ENST00000403441 A8MWP4 228 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 MTURNQ8N3F0 131 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.2□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 PRO0461Q9UI25 63 aa6.18□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.17□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 NDUFB1O75438 58 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 MT1FP04733 61 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP10-10P60014 251 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.16□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 NREPQ16612 68 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.15□□□□□ -1.42
PRAME-204ENST00000403441 K7EP34 96 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 PRR15Q8IV56 129 aa6.14□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 HRES1P13985 223 aa6.13□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.12□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.11□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 LINC00846Q9NV44 126 aa6.1□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 K7EQZ3 153 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 Q6ZVQ6 151 aa6.09□□□□□ -1.43
PRAME-204ENST00000403441 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.08□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 BPY2O14599 106 aa6.05□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.04□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 hDV103S1A0JD37 113 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 F8W1H4 67 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 SPINK7P58062 85 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.03□□□□□ -1.44
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-204ENST00000403441 Q8N9L7 120 aa5.99□□□□□ -1.45
PRAME-204ENST00000403441 UBL5Q9BZL1 73 aa5.98□□□□□ -1.45
PRAME-204ENST00000403441 H3BS24 57 aa5.97□□□□□ -1.45
PRAME-204ENST00000403441 ETDBQ3ZM63 59 aa5.97□□□□□ -1.45
PRAME-204ENST00000403441 CASC2Q6XLA1 102 aa5.95□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 Q5W150 140 aa5.94□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.93□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 CXCL6P80162 114 aa5.92□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 HCG22E2RYF7 251 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 NDUFS5O43920 106 aa5.91□□□□□ -1.46
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.88□□□□□ -1.47
PRAME-204ENST00000403441 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-204ENST00000403441 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.87□□□□□ -1.47
PRAME-204ENST00000403441 ACYP1P07311 99 aa5.86□□□□□ -1.47
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 IGKV2-30P06310 120 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 NEBP20929 6669 aa5.83□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.81□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.81□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa5.79□□□□□ -1.48
PRAME-204ENST00000403441 A0A1B0GV90 55 aa5.77□□□□□ -1.49
PRAME-204ENST00000403441 C4orf26Q17RF5 130 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.75□□□□□ -1.49
PRAME-204ENST00000403441 LINC00643Q86TS7 51 aa5.71□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.69□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.68□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 A6NN06 94 aa5.67□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.66□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 A0A087WVE0 104 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.65□□□□□ -1.5
PRAME-204ENST00000403441 UQCRQO14949 82 aa5.64□□□□□ -1.51
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