RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 COL6A5A8TX70 2615 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 A8MUU9 505 aa5.66□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 ANAPC11Q9NYG5 84 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 MAST4O15021 2626 aa5.65□□□□□ -1.5
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.65□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.65□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0A0MQY5 61 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 SPRR1BP22528 89 aa5.64□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 H3BNG1 76 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 IGLV7-43P04211 117 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 IGKV2-30P06310 120 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD1-203ENST00000395211 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 NDUFAF8A1L188 74 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 LINC00483Q53H64 154 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.57□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.57□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.56□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.55□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 C14orf177Q52M58 125 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 SMR3AQ99954 134 aa5.54□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 H0YAA0 97 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 Q8N1X5 172 aa5.53□□□□□ -1.52
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZSA8 131 aa5.5□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 PANO1I0J062 215 aa5.49□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 LY6G6CO95867 125 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 K7ERS5 55 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.48□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.47□□□□□ -1.53
TMOD1-203ENST00000395211 A0A1B0GU33 70 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 STAB2Q8WWQ8 2551 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 TGP01266 2768 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.46□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.45□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 ANK2Q01484 3957 aa5.44□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.43□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 STAB1Q9NY15 2570 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-11P60412 298 aa5.42□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa5.41□□□□□ -1.54
TMOD1-203ENST00000395211 NUPR2A6NF83 97 aa5.4□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 A0A087WTM6 91 aa5.39□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.38□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.37□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 LYSTQ99698 3801 aa5.35□□□□□ -1.55
TMOD1-203ENST00000395211 A0A0D9SG42 100 aa5.33□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 TPRXLQ17RH7 258 aa5.33□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.31□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 DNHD1Q96M86 4753 aa5.3□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 MGAM2Q2M2H8 2515 aa5.3□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.3□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 LUZP6Q538Z0 58 aa5.28□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.28□□□□□ -1.56
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.27□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.26□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 APLNQ9ULZ1 77 aa5.24□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.23□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
TMOD1-203ENST00000395211 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.19□□□□□ -1.58
TMOD1-203ENST00000395211 FBN3Q75N90 2809 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.18□□□□□ -1.58
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.15□□□□□ -1.58
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.12□□□□□ -1.59
TMOD1-203ENST00000395211 C9orf92A6NGG3 77 aa5.11□□□□□ -1.59
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.1□□□□□ -1.59
TMOD1-203ENST00000395211 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.08□□□□□ -1.6
TMOD1-203ENST00000395211 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
TMOD1-203ENST00000395211 S4R3F8 94 aa5.03□□□□□ -1.6
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.01□□□□□ -1.61
TMOD1-203ENST00000395211 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP12-2P59991 146 aa4.98□□□□□ -1.61
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
TMOD1-203ENST00000395211 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
TMOD1-203ENST00000395211 KMT2AQ03164 3969 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD1-203ENST00000395211 PLAC4Q8WY50 150 aa4.91□□□□□ -1.62
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 LCE2CQ5TA81 110 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.9□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.88□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 XP32Q5T750 250 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 LCE2BO14633 110 aa4.86□□□□□ -1.63
TMOD1-203ENST00000395211 KRTAP12-1P59990 96 aa4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms