RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368210.7

PTPRK-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRK, Length 5,025 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-204ENST00000368210 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 Q6ZR54 194 aa7.93□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 FBN2P35556 2912 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-2P60368 255 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 TENM4Q6N022 2769 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-1P60331 282 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRK-204ENST00000368210 Q5W150 140 aa7.9□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 LINC00483Q53H64 154 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 NDUFAF8A1L188 74 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-204ENST00000368210 Q6ZSA8 131 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-204ENST00000368210 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.8□□□□□ -1.16
PTPRK-204ENST00000368210 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRK-204ENST00000368210 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRK-204ENST00000368210 RELNP78509 3460 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 Q5VSD8 79 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.67□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 A8MUU9 505 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRK-204ENST00000368210 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRK-204ENST00000368210 S4R3F8 94 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRK-204ENST00000368210 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRK-204ENST00000368210 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 MUC3AQ02505 3323 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 LAMA5O15230 3695 aa7.56□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.55□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 TENM3Q9P273 2699 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.53□□□□□ -1.2
PTPRK-204ENST00000368210 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRK-204ENST00000368210 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-204ENST00000368210 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRK-204ENST00000368210 M0R2T5 61 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-204ENST00000368210 R4GN34 69 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRK-204ENST00000368210 DMDP11532 3685 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRK-204ENST00000368210 PDZD2O15018 2839 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRK-204ENST00000368210 PLAC4Q8WY50 150 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRK-204ENST00000368210 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRK-204ENST00000368210 TENM2Q9NT68 2774 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-204ENST00000368210 M0QZ58 72 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRK-204ENST00000368210 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRK-204ENST00000368210 VWFP04275 2813 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 TGP01266 2768 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 H0YAA0 97 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRK-204ENST00000368210 P0C880 135 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRK-204ENST00000368210 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-204ENST00000368210 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRK-204ENST00000368210 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-204ENST00000368210 ZFHX3Q15911 3703 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRK-204ENST00000368210 PP632Q6XCG6 107 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRK-204ENST00000368210 XP32Q5T750 250 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRK-204ENST00000368210 CUBNO60494 3623 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRK-204ENST00000368210 CSMD2Q7Z408 3487 aa7□□□□□ -1.29
PTPRK-204ENST00000368210 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-204ENST00000368210 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-204ENST00000368210 TNP1P09430 55 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 FBN3Q75N90 2809 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 TPRXLQ17RH7 258 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 A0A1B0GVY2 172 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRK-204ENST00000368210 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-8P60410 259 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-204ENST00000368210 BSNQ9UPA5 3926 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRK-204ENST00000368210 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-204ENST00000368210 COL7A1Q02388 2944 aa6.71□□□□□ -1.34
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP12-2P59991 146 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-10P60014 251 aa6.52□□□□□ -1.37
PTPRK-204ENST00000368210 VPS13CQ709C8 3753 aa6.51□□□□□ -1.37
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP12-1P59990 96 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-204ENST00000368210 INE1O15225 51 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRK-204ENST00000368210 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-204ENST00000368210 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-204ENST00000368210 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRK-204ENST00000368210 MT1HL1P0DM35 61 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-204ENST00000368210 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-204ENST00000368210 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-204ENST00000368210 AKAP9Q99996 3911 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.16□□□□□ -1.42
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.13□□□□□ -1.43
PTPRK-204ENST00000368210 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-204ENST00000368210 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.04□□□□□ -1.44
PTPRK-204ENST00000368210 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.4 ms