RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 A0A0A0MQY5 61 aa5.16□□□□□ -1.58
GINS1-201ENST00000262460 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 NDUFB1O75438 58 aa5.14□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 C1orf134Q5TEV5 83 aa5.14□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 CD164Q04900 197 aa5.13□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.13□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.13□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 ZNF861PO60384 105 aa5.13□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 Q6ZR54 194 aa5.12□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 Q5W150 140 aa5.12□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 V9GYY9 64 aa5.11□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 CDK2AP2O75956 126 aa5.11□□□□□ -1.59
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GINS1-201ENST00000262460 H3BS24 57 aa5.1□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GVX0 72 aa5.09□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 PLAC8Q9NZF1 115 aa5.09□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 IGLV7-43P04211 117 aa5.09□□□□□ -1.59
GINS1-201ENST00000262460 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.08□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-1P60331 282 aa5.08□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 LINC00483Q53H64 154 aa5.08□□□□□ -1.6
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GINS1-201ENST00000262460 COA5Q86WW8 74 aa5.08□□□□□ -1.6
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GINS1-201ENST00000262460 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.06□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 FAT1Q14517 4588 aa5.05□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
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GINS1-201ENST00000262460 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.04□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 Q1T7F1 81 aa5.04□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 Q5VV11 94 aa5.04□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
GINS1-201ENST00000262460 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
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GINS1-201ENST00000262460 HRES1P13985 223 aa5.01□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa5.01□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 C1orf195Q5TG92 126 aa4.99□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.98□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 A6NED7 52 aa4.97□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.97□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 IGKV2-30P06310 120 aa4.97□□□□□ -1.61
GINS1-201ENST00000262460 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.96□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 H3BPC8 53 aa4.96□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 LINC00313P59037 77 aa4.96□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 LCA10Q71F78 164 aa4.96□□□□□ -1.62
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GINS1-201ENST00000262460 SPINK7P58062 85 aa4.95□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.95□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.93□□□□□ -1.62
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GINS1-201ENST00000262460 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.93□□□□□ -1.62
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GINS1-201ENST00000262460 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.82□□□□□ -1.64
GINS1-201ENST00000262460 C8orf87E5RJ46 101 aa4.82□□□□□ -1.64
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GINS1-201ENST00000262460 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.79□□□□□ -1.64
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GINS1-201ENST00000262460 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.78□□□□□ -1.64
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GINS1-201ENST00000262460 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.76□□□□□ -1.65
GINS1-201ENST00000262460 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.76□□□□□ -1.65
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GINS1-201ENST00000262460 LCE2BO14633 110 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 LPAP08519 4548 aa4.7□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.68□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.68□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.67□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 A0A1B0GVY2 172 aa4.66□□□□□ -1.66
GINS1-201ENST00000262460 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.66□□□□□ -1.66
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