RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 FBN2P35556 2912 aa6.07□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa6.07□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.06□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 Q6ZSA8 131 aa6.06□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 ATMQ13315 3056 aa6.04□□□□□ -1.44
TTL-201ENST00000233336 LCE6AA0A183 80 aa6.02□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 R4GN34 69 aa6.01□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.01□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 SPEGQ15772 3267 aa5.98□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 A0A087X002 238 aa5.97□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.97□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.96□□□□□ -1.45
TTL-201ENST00000233336 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.94□□□□□ -1.46
TTL-201ENST00000233336 PANO1I0J062 215 aa5.94□□□□□ -1.46
TTL-201ENST00000233336 M0QZ58 72 aa5.92□□□□□ -1.46
TTL-201ENST00000233336 PDZD2O15018 2839 aa5.9□□□□□ -1.46
TTL-201ENST00000233336 EYSQ5T1H1 3165 aa5.9□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 PLAC4Q8WY50 150 aa5.89□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 TGP01266 2768 aa5.88□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa5.87□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 A8MUU9 505 aa5.87□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.87□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-1P60331 282 aa5.87□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-2P60368 255 aa5.85□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 M0R2T5 61 aa5.84□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa5.84□□□□□ -1.47
TTL-201ENST00000233336 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.83□□□□□ -1.48
TTL-201ENST00000233336 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.82□□□□□ -1.48
TTL-201ENST00000233336 TENM3Q9P273 2699 aa5.82□□□□□ -1.48
TTL-201ENST00000233336 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
TTL-201ENST00000233336 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.76□□□□□ -1.49
TTL-201ENST00000233336 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.75□□□□□ -1.49
TTL-201ENST00000233336 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.74□□□□□ -1.49
TTL-201ENST00000233336 Q5VSD8 79 aa5.73□□□□□ -1.49
TTL-201ENST00000233336 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.72□□□□□ -1.49
TTL-201ENST00000233336 LAMA5O15230 3695 aa5.7□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.69□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.69□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 TENM4Q6N022 2769 aa5.69□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.68□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 CSMD1Q96PZ7 3565 aa5.66□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 VWFP04275 2813 aa5.65□□□□□ -1.5
TTL-201ENST00000233336 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 RELNP78509 3460 aa5.63□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.62□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 DMDP11532 3685 aa5.61□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.61□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TTL-201ENST00000233336 H0YAA0 97 aa5.58□□□□□ -1.52
TTL-201ENST00000233336 P0C880 135 aa5.54□□□□□ -1.52
TTL-201ENST00000233336 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa5.53□□□□□ -1.52
TTL-201ENST00000233336 TNP1P09430 55 aa5.5□□□□□ -1.53
TTL-201ENST00000233336 PP632Q6XCG6 107 aa5.48□□□□□ -1.53
TTL-201ENST00000233336 TENM2Q9NT68 2774 aa5.46□□□□□ -1.54
TTL-201ENST00000233336 SVEP1Q4LDE5 3571 aa5.44□□□□□ -1.54
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-8P60410 259 aa5.41□□□□□ -1.54
TTL-201ENST00000233336 COL7A1Q02388 2944 aa5.4□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.4□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 ZFHX3Q15911 3703 aa5.39□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 CUBNO60494 3623 aa5.37□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 FBN3Q75N90 2809 aa5.36□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.36□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.34□□□□□ -1.55
TTL-201ENST00000233336 VPS13CQ709C8 3753 aa5.32□□□□□ -1.56
TTL-201ENST00000233336 XP32Q5T750 250 aa5.31□□□□□ -1.56
TTL-201ENST00000233336 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.3□□□□□ -1.56
TTL-201ENST00000233336 OTOGQ6ZRI0 2925 aa5.23□□□□□ -1.57
TTL-201ENST00000233336 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.21□□□□□ -1.58
TTL-201ENST00000233336 TPRXLQ17RH7 258 aa5.17□□□□□ -1.58
TTL-201ENST00000233336 KRTAP12-2P59991 146 aa5.17□□□□□ -1.58
TTL-201ENST00000233336 MUC3AQ02505 3323 aa5.17□□□□□ -1.58
TTL-201ENST00000233336 A0A1B0GVY2 172 aa5.15□□□□□ -1.58
TTL-201ENST00000233336 BSNQ9UPA5 3926 aa5.06□□□□□ -1.6
TTL-201ENST00000233336 KRTAP12-1P59990 96 aa5.05□□□□□ -1.6
TTL-201ENST00000233336 CSMD2Q7Z408 3487 aa5.05□□□□□ -1.6
TTL-201ENST00000233336 AKAP9Q99996 3911 aa5.03□□□□□ -1.6
TTL-201ENST00000233336 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.02□□□□□ -1.61
TTL-201ENST00000233336 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.01□□□□□ -1.61
TTL-201ENST00000233336 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.99□□□□□ -1.61
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-10P60014 251 aa4.99□□□□□ -1.61
TTL-201ENST00000233336 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.98□□□□□ -1.61
TTL-201ENST00000233336 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.96□□□□□ -1.62
TTL-201ENST00000233336 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.91□□□□□ -1.62
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
TTL-201ENST00000233336 INE1O15225 51 aa4.89□□□□□ -1.63
TTL-201ENST00000233336 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
TTL-201ENST00000233336 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.72□□□□□ -1.65
TTL-201ENST00000233336 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.7□□□□□ -1.66
TTL-201ENST00000233336 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.68□□□□□ -1.66
TTL-201ENST00000233336 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TTL-201ENST00000233336 LYSTQ99698 3801 aa4.5□□□□□ -1.69
TTL-201ENST00000233336 KRTAP10-12P60413 245 aa4.49□□□□□ -1.69
TTL-201ENST00000233336 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.46□□□□□ -1.7
TTL-201ENST00000233336 MT1HL1P0DM35 61 aa4.45□□□□□ -1.7
TTL-201ENST00000233336 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.43□□□□□ -1.7
TTL-201ENST00000233336 KRTAP12-3P60328 96 aa4.4□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms