RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637434.1

SPTAN1-235, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 1,496 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-235ENST00000637434 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa7.04□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6ZQY7 126 aa7.03□□□□□ -1.28
SPTAN1-235ENST00000637434 MUC2Q02817 5179 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A0G2JQZ4 141 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 SMIM29Q86T20 159 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 Q8N377 158 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.02□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.01□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 TRIAP1O43715 76 aa7□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 LPAP08519 4548 aa6.99□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 PSMB2P49721 201 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 CLEC2BQ92478 149 aa6.98□□□□□ -1.29
SPTAN1-235ENST00000637434 SPINK1P00995 79 aa6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 H0YGX0 51 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 BATFQ16520 125 aa6.95□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 F8WEM9 126 aa6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.92□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 H3BUT2 72 aa6.92□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 SNCGO76070 127 aa6.92□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1B0GV72 72 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 TAX1BP3O14907 124 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.91□□□□□ -1.3
SPTAN1-235ENST00000637434 COX6CP09669 75 aa6.9□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 FABP2P12104 132 aa6.9□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.89□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 IGFL1Q6UW32 110 aa6.88□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1B0GX51 115 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 DNAL4O96015 105 aa6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.86□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 LIMD2Q9BT23 127 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 CD164Q04900 197 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 UBE2V1Q13404 147 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.85□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 LST1O00453 97 aa6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6JHZ5 121 aa6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 CDIP1Q9H305 208 aa6.84□□□□□ -1.31
SPTAN1-235ENST00000637434 H3BMG7 143 aa6.83□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 TPRXLQ17RH7 258 aa6.82□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 C9orf118A6NHY6 69 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 TCL1BO95988 128 aa6.81□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.8□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 TRACP01848 142 aa6.8□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.8□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 C1orf195Q5TG92 126 aa6.79□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 GHRHP01286 108 aa6.79□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 C9orf92A6NGG3 77 aa6.78□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.78□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 ATXN8Q156A1 80 aa6.78□□□□□ -1.32
SPTAN1-235ENST00000637434 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.77□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 Q5XG85 94 aa6.76□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A087WSZ3 146 aa6.75□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1W2PNM2 257 aa6.75□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 K7EP34 96 aa6.75□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.75□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 A0A1W2PPM0 123 aa6.74□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 H3BQ85 93 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 TEN1Q86WV5 123 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 MTURNQ8N3F0 131 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 VPS25Q9BRG1 176 aa6.73□□□□□ -1.33
SPTAN1-235ENST00000637434 C9JAW5 83 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 CCKP06307 115 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 XP32Q5T750 250 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6Q795 121 aa6.71□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.7□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.69□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 MUC17Q685J3 4493 aa6.68□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 DSCR8Q96T75 97 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.67□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 Q96NJ1 140 aa6.66□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.65□□□□□ -1.34
SPTAN1-235ENST00000637434 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.65□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 SIGMAR1Q99720 223 aa6.64□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 PRO0461Q9UI25 63 aa6.63□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 F8W1H4 67 aa6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 IGKV4-1P06312 121 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 PCOTHQ58A44 107 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 Q6ZQT0 140 aa6.6□□□□□ -1.35
SPTAN1-235ENST00000637434 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.2 ms