RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630804.2

SPTAN1-222, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, human

TSL 5 BASIC

Gene SPTAN1, Length 7,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPTAN1-222	ENST00000630804	CFAP54	Q96N23	3096 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804		A0A096LNT2	108 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804		R4GN34	69 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804		S4R3F8	94 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		5.28	□□□□□ -1.56
SPTAN1-222	ENST00000630804	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		5.27	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	5.27	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q5XG85	94 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.26	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	PLAC4	Q8WY50	150 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804		A0A1W2PNM2	257 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		5.25	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	5.25	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	SZT2	Q5T011	3432 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	VCAN	P13611	3396 aa		5.24	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.22	□□□□□ -1.57
SPTAN1-222	ENST00000630804	ROMO1	P60602	79 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.21	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	NOTCH1	P46531	2555 aa		5.2	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.19	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPEG	Q15772	3267 aa		5.18	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.17	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	TNP2	Q05952	138 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	ZNF292	O60281	2723 aa		5.16	□□□□□ -1.58
SPTAN1-222	ENST00000630804	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRIO	O75962	3097 aa		5.15	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.14	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q5VV11	94 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	CASC10	Q5T4H9	136 aa		5.13	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804		M0QZ58	72 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	COL6A3	P12111	3177 aa		5.12	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	KMT2B	Q9UMN6	2715 aa	Predicted RBP	5.11	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q5VSD8	79 aa		5.11	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	OXT	P01178	125 aa		5.1	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	ITPR2	Q14571	2701 aa		5.09	□□□□□ -1.59
SPTAN1-222	ENST00000630804	LAMA1	P25391	3075 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	EYS	Q5T1H1	3165 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q5W150	140 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		5.08	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	MGA	Q8IWI9	3026 aa		5.07	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	HTT	P42858	3142 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		5.06	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SPTAN1-222	ENST00000630804	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q8NDZ9	215 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.96	□□□□□ -1.61
SPTAN1-222	ENST00000630804	TRANK1	O15050	2925 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPRR1A	P35321	89 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	FRYL	O94915	3013 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	SPRR1B	P22528	89 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	LCE6A	A0A183	80 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	PANO1	I0J062	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SPTAN1-222	ENST00000630804	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804		Q6ZR54	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804		A8MUU9	505 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804	APC	P25054	2843 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SPTAN1-222	ENST00000630804	ITPR1	Q14643	2758 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	FLNC	Q14315	2725 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	TNP1	P09430	55 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPTAN1-222	ENST00000630804	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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