RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626595.2

TCF4-255, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 833 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-255	ENST00000626595	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595		F8WDY8	70 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	COX7B	P24311	80 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	NREP	Q16612	68 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	DIRC1	Q969H9	104 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	FAT1	Q14517	4588 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	LYRM9	A8MSI8	78 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	DEFB4A	O15263	64 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595		Q5VSD8	79 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	RMI2	Q96E14	147 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	CELA1	Q9UNI1	258 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	RNF213	Q63HN8	5207 aa		5.03	□□□□□ -1.6
TCF4-255	ENST00000626595	BPY2	O14599	106 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595		Q6ZQY7	126 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595		A0A0U1RQV1	116 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	REG3A	Q06141	175 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595		Q6ZTC4	211 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		5.01	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595		M0R378	163 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	OCR1	Q9BZK8	76 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	SNURF	Q9Y675	71 aa		5	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595		Q8NDZ9	215 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.99	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	ESRG	Q1W209	222 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	LELP1	Q5T871	98 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
TCF4-255	ENST00000626595	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	VPREB1	P12018	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595		Q1T7F1	81 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595		Q8NAQ8	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.95	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595		V9GYY9	64 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595		H3BNG1	76 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	DAD1	P61803	113 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	NDUFB1	O75438	58 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TCF4-255	ENST00000626595	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		Q6ZRU5	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	IGLV5-37	A0A075B6J1	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		H3BPC8	53 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		Q8N377	158 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		A0A096LPF7	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SEC61G	P60059	68 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		Q8NBF4	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SPRR1A	P35321	89 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595		A0A1W2PNM2	257 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	HTN3	P15516	51 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.84	□□□□□ -1.63
TCF4-255	ENST00000626595	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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