RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623650.3

SNHG5-217, Transcript of small nucleolar RNA host gene 5, human

TSL 5

Gene SNHG5, Length 886 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNHG5-217	ENST00000623650	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		5.03	□□□□□ -1.6
SNHG5-217	ENST00000623650		A0A1W2PPM0	123 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650		F8WEM9	126 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	ZNF861P	O60384	105 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	HERC2	O95714	4834 aa		5.02	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	TAX1BP3	O14907	124 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	SPRR1A	P35321	89 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	SEC61G	P60059	68 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650		Q5VSD8	79 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		5.01	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	LINC00575	Q6W349	94 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	ORMDL1	Q9P0S3	153 aa		5	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	PKD1	P98161	4303 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	TRAC	P01848	142 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	LST1	O00453	97 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650		Q6ZQY7	126 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SNHG5-217	ENST00000623650	TMEM256-PLSCR3	K7ERE1	68 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		C9JAW5	83 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		K7EP34	96 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	TCL1B	O95988	128 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		Q9BRP9	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		A0A087X002	238 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		H3BMG7	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650		H3BT86	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	CRYGA	P11844	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	JMJD7-PLA2G4B	H0Y9G9	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	ERC2-IT1	O76042	136 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SNHG5-217	ENST00000623650	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		F8W1H4	67 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		Q8NBF4	154 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	RYR1	P21817	5038 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		Q6JHZ5	121 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		A0A1B0GV72	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		A0A1B0GV90	55 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	PDE6G	P18545	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	SPRR1B	P22528	89 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	MOBP	Q13875	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	ABCA13	Q86UQ4	5058 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		Q8N377	158 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	HSPG2	P98160	4391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	OXT	P01178	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650		J3QR89	54 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SNHG5-217	ENST00000623650	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	CCK	P06307	115 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	ETDB	Q3ZM63	59 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	LOC110117498	A0A087WWA1	95 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	SPINK1	P00995	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	CD164	Q04900	197 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SNHG5-217	ENST00000623650	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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