RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
LETMD1-238	ENST00000623495	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.77	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BNG1	76 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	RTL8C	O15255	209 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	REG3A	Q06141	175 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.76	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495		A8MU10	97 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.75	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495		Q75L30	129 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.74	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	NDUFB1	O75438	58 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		4.72	□□□□□ -1.65
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZR54	194 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.71	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.7	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		A6NED7	52 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	COX7B	P24311	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		Q9BRP9	147 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.69	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087WTM6	91 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01554	Q52M75	96 aa		4.68	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		4.67	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	MOBP	Q13875	183 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8N9L7	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00208	Q96KT6	92 aa		4.66	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZQY7	126 aa		4.65	□□□□□ -1.66
LETMD1-238	ENST00000623495	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	COX17	Q14061	63 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.65	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GUV1	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.64	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GW54	56 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC00313	P59037	77 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		Q8IZM0	81 aa		4.63	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A087X002	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	MP68	P56378	58 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR4	Q16378	134 aa		4.62	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495		H3BPC8	53 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	PANO1	I0J062	215 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	IGLV6-57	P01721	117 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	FAT1	Q14517	4588 aa		4.59	□□□□□ -1.67
LETMD1-238	ENST00000623495	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	DYNC1H1	Q14204	4646 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		4.58	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.57	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A1B0GVY2	172 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.56	□□□□□ -1.68
LETMD1-238	ENST00000623495		A0A096LNI7	61 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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