RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP1-1Q07627 177 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRT-210ENST00000617474 C7orf65Q6ZTY9 151 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-210ENST00000617474 ANAPC11Q9NYG5 84 aa9.98□□□□□ -0.81
PTPRT-210ENST00000617474 RTL8CO15255 209 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPRT-210ENST00000617474 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 OCR1Q9BZK8 76 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 STAB2Q8WWQ8 2551 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00313P59037 77 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 K7EIL1 84 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 TLX1NBP0CAT3 122 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 C8orf17Q9NRJ1 99 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 DCHS1Q96JQ0 3298 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 ITPR2Q14571 2701 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPRT-210ENST00000617474 HIVEP1P15822 2718 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 DSCR10P59022 87 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa9.87□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf163Q8N9P6 203 aa9.85□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 Q5XG85 94 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 NF1P21359 2839 aa9.84□□□□□ -0.83
PTPRT-210ENST00000617474 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 LAMA5O15230 3695 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 A0A1B0GVX0 72 aa9.83□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 DMDP11532 3685 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 FAM229BQ4G0N7 80 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 RELNP78509 3460 aa9.82□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 OXTP01178 125 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP9.81□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 APCP25054 2843 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 Q96NJ1 140 aa9.81□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 FBN2P35556 2912 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 FAM229AH3BQW9 127 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 TYMSOSQ8TAI1 123 aa9.8□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa9.79□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 DCHS2Q6V1P9 2916 aa9.78□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 ZNF861PO60384 105 aa9.77□□□□□ -0.84
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR4Q96PI1 79 aa9.77□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 C8orf87E5RJ46 101 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 PRR26Q8N8Z3 221 aa9.76□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 A0A087WTM6 91 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa9.73□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 CNBPP62633 177 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
PTPRT-210ENST00000617474 UQCR11O14957 56 aa9.71□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP9.71□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 WIPF1O43516 503 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 ZFHX4Q86UP3 3567 aa9.7□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP9.69□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP9.68□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP9.67□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 Q1T7F1 81 aa9.66□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 APLNQ9ULZ1 77 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.65□□□□□ -0.86
PTPRT-210ENST00000617474 CD164Q04900 197 aa9.64□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR1AP35321 89 aa9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP9.63□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV7-43P04211 117 aa9.61□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 C9orf92A6NGG3 77 aa9.6□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 Q8N1X5 172 aa9.59□□□□□ -0.87
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.58□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.56□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa9.53□□□□□ -0.88
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00304Q8N9R0 145 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 LCA10Q71F78 164 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.5□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 HRES1P13985 223 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 Q5VV11 94 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 MXRA5Q9NR99 2828 aa9.48□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 TNP2Q05952 138 aa9.47□□□□□ -0.89
PTPRT-210ENST00000617474 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.45□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 Q75L30 129 aa9.44□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa9.43□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.42□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 PRAC1Q96KF2 57 aa9.41□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 SPINK7P58062 85 aa9.4□□□□□ -0.9
PTPRT-210ENST00000617474 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa9.39□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 SPRR1BP22528 89 aa9.38□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 A0A0D9SG42 100 aa9.37□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 CSMD1Q96PZ7 3565 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 TENM4Q6N022 2769 aa9.35□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 PANO1I0J062 215 aa9.34□□□□□ -0.91
PTPRT-210ENST00000617474 CUBNO60494 3623 aa9.3□□□□□ -0.92
PTPRT-210ENST00000617474 Q5W150 140 aa9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-210ENST00000617474 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
PTPRT-210ENST00000617474 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms